Bacterial population dynamics and separation of active degraders by stable isotope probing during benzene degradation in a BTEX–impacted aquifer



Document title: Bacterial population dynamics and separation of active degraders by stable isotope probing during benzene degradation in a BTEX–impacted aquifer
Journal: Revista internacional de contaminación ambiental
Database: PERIÓDICA
System number: 000325105
ISSN: 0188-4999
Authors: 1
2
Institutions: 1Universidad Autónoma Metropolitana, Cuajimalpa, Distrito Federal. México
2Flinders University of South Australia, School of Biological Sciences, Adelaide, Australia Meridional. Australia
Year:
Season: Ago
Volumen: 25
Number: 3
Pages: 147-156
Country: México
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
Spanish abstract RESUMEN El presente estudio investiga la dinámica de poblaciones durante la degradación de benceno en muestras de un acuífero contaminado con BTEX mediante la técnica de DGGE, obtención de bandas y su posterior secuenciación. Los resultados indican degradación aeróbica de benceno en todas las muestras y que las poblaciones son diferentes en cada muestra, pero se mantienen estables durante la degradación del contaminante. Las principales bandas obtenidas en el gel de poliacrilamida fueron secuenciadas e identificadas como Pseudomonas putida y Acidovorax delafieldii en las muestras 308s y W6s respectivamente, lo que sugiere que estos microorganismos son los principales degradadores en ciertas muestras. Mediante el uso de isótopos estables se comprobó la existencia de microorganismos aerobios degradadores de benceno, los cuales fueron identificados como miembros de los géneros Acidovorax y presumiblemente Hydrogenophaga en otra de las muestras. La identificación de comunidades prominentes brinda información sobre los procesos que ocurren in situ y del potencial para aumentar la degradación. El presente estudio muestra el potencial de combinar técnicas como DGGE con isótopos estables
English abstract ABSTRACT The activity and diversity of a groundwater bacterial community was studied during the degradation of benzene in samples from a BTEX–contaminated aquifer (SIReN, UK) through the use of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), followed by excision and sequencing of dominant bands. Rapid aerobic benzene degradation occurred in all samples, with 60–70 % degradation of benzene. DGGE analysis revealed that unique, stable bacterial communities were formed in each sample. Pseudomonas putida and Acidovorax delafieldii were identified in groundwater samples 308s and W6s respectively, suggesting they are the important taxa involved in the degradation of benzene. Further work based on stable isotope probing (SIP) of RNA using 13C benzene was carried out. Prominent bands were identified as Acidovorax and Malikia genera; the latter is very similar to the benzene–degrader Hydrogenophaga, which confirms the presence of active benzene degraders in the groundwater samples. The identification of the prominent communities provides knowledge of the bioremediation processes occurring in situ and the potential to enhance degradation. This study highlights the potential of combining community fingerprinting techniques, such as DGGE, together with SIP
Disciplines: Ingeniería,
Biología
Keyword: Ingeniería hidráulica,
Ecología,
Contaminación,
Degradación,
Isótopos estables,
Aguas subterráneas,
Dinámica de poblaciones
Keyword: Engineering,
Biology,
Hydraulic engineering,
Ecology,
Degradation,
Stable isotopes,
Groundwater,
Population dynamics
Full text: Texto completo (Ver HTML)