Análisis molecular de la diversidad genética en guanábana ( Annona muricata L.) mediante marcadores SRAP



Document title: Análisis molecular de la diversidad genética en guanábana ( Annona muricata L.) mediante marcadores SRAP
Journal: Revista fitotecnia mexicana
Database: PERIÓDICA
System number: 000443137
ISSN: 0187-7380
Authors: 1
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Institutions: 1Universidad Autónoma de Nayarit, Unidad Académica de Agricultura, Tepic, Nayarit. México
2Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Centro Nacional de Recursos Genéticos, Tepatitlán, Jalisco. México
3Universidad Autónoma de Nayarit, Unidad de Tecnología de Alimentos, Tepic, Nayarit. México
Year:
Season: Jul-Sep
Volumen: 42
Number: 3
Pages: 209-214
Country: México
Language: Español
Document type: Nota breve o noticia
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract El conocimiento sobre la diversidad genética de las plantas cultivadas es de gran importancia ante escenarios de cambio climático y presencia de plagas y enfermedades. México es considerado uno de los países con más diversidad de especies y con una alta producción agrícola; por lo tanto, los cultivos con baja diversidad genética se encuentran en una situación de vulnerabilidad. El estudio de la diversidad genética en plantas puede abordarse mediante dos metodologías: la caracterización morfológica y la molecular. La primera metodología depende de las interacciones con el ambiente, pudiendo generar datos ambiguos, mientras que la segunda, al detectar secuencias específicas en el ADN, se considera estable y de mayor confianza. El objetivo de esta investigación fue evaluar, por primera vez, la capacidad de los marcadores moleculares SRAP (Polimorfismos Amplificados Relacionados con la Secuencia) para determinar el nivel de diversidad genética de 88 genotipos de guanábana (Annona muricata L.) provenientes de cinco huertos comerciales del municipio de Compostela, Nayarit, México (principal productor a nivel mundial). Se seleccionaron tres combinaciones polimórficas y reproducibles de marcadores SRAP que revelaron 126 alelos y 76.67 % de polimorfismo, el número promedio de bandas observadas con estas combinaciones fue de 42. Los valores de heterocigosidad esperada (He) variaron entre las poblaciones de 0.144 a 0.176. Los análisis de agrupamiento mostraron cuatro grupos principales. Los resultados del análisis molecular de varianza indicaron que la mayor variación se encuentra dentro de las poblaciones (88 %). La información generada de esta investigación puede ser útil para construir estrategias de conservación y manejo del cultivo
English abstract Knowledge of genetic diversity of cultivated plants is important under the climate change scenario and the presence of pests and diseases. Mexico is considered one of the countries with the largest diversity of species and agricultural production; therefore, crops with low genetic diversity are in a vulnerable situation. The study of genetic diversity in plants can be addressed through two methodologies: morphological and molecular characterization. The first methodology depends on environmental interactions, generating ambiguous data, while the second one, being able to detect specific DNA sequences, is considered stable and more reliable. The objective of this research was to evaluate, for the first time, the ability of SRAP (Sequence- related amplified polymorphisms) molecular markers to determine the levels of genetic diversity of 88 soursop (Annona muricata L.) genotypes from five commercial orchards of the municipality of Compostela, Nayarit, Mexico (the world’s leading producer). Three polymorphic and reproducible combinations of SRAP markers were selected that revealed 126 alleles and 76.67 % polymorphism, the average number of bands observed with these combinations was 42. The expected heterozygosity (He) values varied among populations from of 0.144 to 0.176. Cluster analyses showed four main groups. Results of the analysis of molecular variance indicated that the largest variation (88 %) is found within populations. The information generated from this research can be useful to devise strategies for conservation and crop management
Disciplines: Agrociencias,
Biología
Keyword: Frutales,
Genética,
Guanábana,
Annona muricata,
Diversidad genética,
Marcadores moleculares,
Marcadores de Polimorfismos Amplificados Relacionados con la Secuencia (SRAP),
Polimorfismo
Keyword: Fruit trees,
Genetics,
Soursop,
Annona muricata,
Genetic diversity,
Molecular markers,
Sequence Related Amplified Polymorphisms (SRAP) markers,
Polymorphism
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