Journal: | Revista de investigaciones marinas |
Database: | PERIÓDICA |
System number: | 000381783 |
ISSN: | 1991-6086 |
Authors: | Robainas, A1 Espinosa, G2 Garcia Machado, E1 |
Institutions: | 1Universidad de La Habana, Centro de Investigaciones Marinas, La Habana. Cuba 2Universidad de La Habana, Facultad de Biología, La Habana. Cuba |
Year: | 2003 |
Volumen: | 24 |
Number: | 2 |
Pages: | 161-164 |
Country: | Cuba |
Language: | Español |
Document type: | Nota breve o noticia |
Approach: | Experimental |
Spanish abstract | En este artículo se discute la estructura del ADN microsatélite del camarón rosado Farfantepenaeus notialis, Pérez Farfante, 1969 . Esta especie, como otras especies de peneidos, presenta un genoma de naturaleza altamente repetitiva con un microsatélite cada aproxima damente 486pb. Los motivos clasificados como perfectos (65.5%) prevalecieron sobre los imperfectos(19.69%) y los compuestos(7.57%), y las repeticiones dinucleotídicas resultaron las más abundantes con el siguiente orden de aparición: CT>GT>AT. No se encontró el motivo (GC)n. Los microsatélites constituidos por las unidades (CT)n y (GT)n resultaron los de mayor longitud. Las secuencias colindantes de la gran mayoría de los microsatélites en contrados constituyen una versión degenerada del mismo, lo cual dificulta el diseño de cebadores es pecíficos para la amplificación de los loci |
English abstract | The present work discusses the microsate llite DNA structure of the pink shrimp Farfantepenaeus notialis, Pérez Farfante, 1969. This species, as other penaeids, presents a highly repetitive genome with a microsatellite approximately every 486bp. The perfect repeated motifs (65,5%) prevailed over the imperfect (19,69%) and the composite motifs (7,57%). The dinucleotide repeated types resulted the most abundant with the following order of appearance CT>GT>AT. The motif GC was not found. The longer microsatellites were those formed by the (CT)n and (GT)n units. The surrounding region s of most sequences were a degenerate d version of themselves so it is difficult, in many cases, to find appropriate and specific primers for loci amplification |
Disciplines: | Biología |
Keyword: | Crustáceos, Genética, Microsatélites, Secuencias repetidas, Camarón rosado, Farfantepenaeus notialis |
Keyword: | Biology, Crustaceans, Genetics, Microsatellites, Repeated simple sequence, Pink shrimp, Farfantepenaeus notialis |
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