The genomic identification of Colombian Acinetobacter baumannii clinical isolates by RFLP-PCR analysis of the 16S-23S rRNA gene spacer region



Document title: The genomic identification of Colombian Acinetobacter baumannii clinical isolates by RFLP-PCR analysis of the 16S-23S rRNA gene spacer region
Journal: Revista colombiana de biotecnología
Database: PERIÓDICA
System number: 000362854
ISSN: 0123-3475
Authors: 1
2
2
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1
3
4
4

2
Institutions: 1Universidad de Los Andes, Mérida. Venezuela
2Universidad Nacional de Colombia, Instituto de Biotecnología, Medellín, Antioquia. Colombia
3Fundación Clínica Shaio, Bogotá. Colombia
4Universidad Surcolombiana, Facultad de Salud Pública, Neiva, Huila. Colombia
Year:
Season: Jun
Volumen: 13
Number: 1
Pages: 110-114
Country: Colombia
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract Con el objeto de identificar la genomoespecie Acinetobacter baumannii, se estudiaron 189 aislamientos pertenecientes al Complejo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus provenientes de cuatro hospitales colombianos (denominados A, B ,C, D) mediante el análisis por RFLP-PCR de la región intergénica espaciadora (ITS) de los genes 16S y 23S rRNA. Se encontraron 120 aislamientos (86.3 % ) pertenecientes a la especie A. baumannii. La estructura de la población fue policlonal, con 19 grupos clonales, 16 de los cuales se hallaron en el hospital C . En los hospitales A, B, y D se encontraron 2 grupos clonales aislados durante diferentes años. En este estudio se propone un método método rápido y fácil para la identificación de Acinetobacter baumanii
English abstract The 16S-23S rRNA gene intergenic spacer (ITS) was analysed by RFLP in this study to identify A. baumannii from 139 isolates from four hospitals (identified as A, B, C and D). One hundred and twenty of these isolates (86.3%) belonged to the A. baumannii species; those identified as being A. baumannii were found to be polyclonal (19 clone groups) when determining the genetic relationships, 16 of them being found in hospital C. Hospitals A, B and D shared two clone groups isolated during different years. This study describes a rapid and easy method for genospecies identification of Acinetobacter baumannii
Disciplines: Medicina
Keyword: Parasitología,
Genética,
Acinetobacter baumannii,
Genómica,
RFLP-PCR,
Gene 16S,
Gene 23S,
ARN ribosomal,
Acinetobacter calcoaceticus,
Espaciadores intergénicos,
Biotecnología
Keyword: Medicine,
Parasitology,
Genetics,
RFLP-PCR,
16S gene,
23S gene,
Ribosomal RNA,
Acinetobacter calcoaceticus,
Intergenic spacers,
Biotechnology
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