Phylogenetic analysis of some members of the subgenus Persea (Persea, Lauraceae)



Document title: Phylogenetic analysis of some members of the subgenus Persea (Persea, Lauraceae)
Journal: Revista Chapingo. Serie horticultura
Database: PERIÓDICA
System number: 000434279
ISSN: 1027-152X
Authors: 1
1
2
1
3
Institutions: 1Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Fitotecnia, Chapingo, Estado de México. México
2Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Centro Nacional de Recursos Genéticos, Tepatitlán, Jalisco. México
3Universidad Autónoma del Estado de México, Tenancingo, Estado de México. México
Year:
Season: May-Ago
Volumen: 24
Number: 2
Country: México
Language: Español, inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract El aguacate pertenece al género Persea, el cual es uno de los más controversiales de la familia Lauraceae debido a que las relaciones entre el subgénero Persea no están claras, y solo se reconocen dos especies, Persea americana y Persea schiedeana. Su relación con el subgénero Eriodaphne también es compleja, y existe un debate sobre si este es un género independiente. Por ello, el objetivo de esta investigación fue analizar las relaciones filogenéticas dentro del género Persea, con énfasis en el subgénero Persea, utilizando la máxima parsimonia e inferencia bayesiana con la secuencia de ocho fragmentos diferentes de ADN nuclear, cloroplástico y mitocondrial. Se emplearon secuencias del cloroplasto ndhF, rbcL, matK, rpoC, trnH-psbA, mitocondrias atp4 y cox3, y 18S rARN nuclear. Se encontraron 14 mutaciones fijas en especies del subgénero Eriodaphne. La máxima parsimonia, los análisis filogenéticos bayesianos de las supermatrices de las cinco secuencias de cloroplastos y las ocho concatenadas separaron a los miembros de ambos subgéneros en dos clados diferentes con un alto bootstrap y soporte de probabilidad posterior. Lo anterior sugiere que el origen de Persea no es monofilético y, por lo tanto, ambos subgéneros, Persea y Eriodaphne, podrían ser reconocidos como géneros filogenéticamente independientes
English abstract The avocado belongs to the genus Persea, which is one of the most controversial genera of the Lauraceae family, since the relationships within the subgenus Persea are not clear and only recognized two species, Persea americana and Persea schiedeana. Its relationship with the subgenus Eriodaphne is also complex and there is a debate as to whether it is an independent genus. For this reason, the study aims to analyze the phylogenetic relationships within the genus Persea, with an emphasis on the subgenus Persea, using maximum parsimony and bayesian inference with the sequence of eight different fragments from nuclear, chloroplast and mitochondrial DNA. Sequences of the chloroplast ndhF, rbcL, matK, rpoC, trnH-psbA; mitochondria atp4 and cox3 and nuclear 18S rRNA were used. Fourteen fixed mutations were found in species of the subgenus Eriodaphne. The maximum parsimony and bayesian phylogenetic analyses of the super-matrices of the five chloroplast sequences and the eight concatenated ones, separated the members of both subgenera into two different clades with high bootstrap and posterior probability support, suggesting that the origin of Persea is not monophyletic and therefore both subgenera, Persea and Eriodaphne, could be recognized as phylogenetically independent genera
Disciplines: Agrociencias,
Biología,
Agrociencias
Keyword: Plantas para uso industrial,
Genética,
Persea,
Aguacate,
Filogenia,
ADN,
Cloroplastos,
ADN mitocondrial
Keyword: Plants for industrial use,
Genetics,
Persea,
Avocado,
Phylogeny,
Chloroplasts,
DNA,
Mitochondrial DNA
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