Uso de marcadores moleculares na análise da variabilidade genética em acerola (Malpighia emarginata D.C.)



Document title: Uso de marcadores moleculares na análise da variabilidade genética em acerola (Malpighia emarginata D.C.)
Journal: Revista brasileira de fruticultura
Database: PERIÓDICA
System number: 000303861
ISSN: 0100-2945
Authors: 1


Institutions: 1Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciencias Biologicas, Londrina, Parana. Brasil
Year:
Season: Abr
Volumen: 24
Number: 1
Pages: 15-22
Country: Brasil
Language: Portugués
Document type: Nota breve o noticia
Approach: Experimental
English abstract Acerola (Malpighia emarginata) is a tropical fruit native from Central America and north of South America. It has shown an increasing economic and social importance due to its high vitamin C (ascorbic acid) content. Vegetative propagation is the preferable method used to establish acerola plantations. However, propagation by seeds has also been used allowing the identification and selection of genotypes that carry characteristics of agronomic interest. Twenty-four acerola accesses, of the Active Germplasm Bank of the Universidade Estadual de Londrina, were analyzed using molecular markers obtained with random amplified polymorphic DNA (RAPD) and simple sequence repeated (SSRs) primers. A total of 164 and 73 markers were obtained with RAPD and SSR primers, respectively. Polymorfic markers were scored as present or absent and analyzed using the UPGMA cluster analysis. The results presented reveal high levels of polymorphism in the studied collection. Comparative analysis of the phenograms, generated with both RAPD and SSR primers, revealed that while some accesses clustered in different groups other accesses presented the same association. However, there was large RAPD variation among the accesses. The associations observed with molecular markers were, for many accesses, the same of those determined on the basis of morphological characters
Portuguese abstract A acerola (Malpighia emarginata) é uma frutífera tropical encontrada nativa na América Central e no Norte da América do Sul, sendo de grande importância econômica e social devido ao seu alto conteúdo de vitamina C (ácido ascórbico). Pomares de acerola têm sido preferencialmente estabelecidos por métodos de propagação vegetiva. No entanto, a propagação sexuada por sementes é igualmente utilizada e permite revelar um alto grau de polimorfismo na cultura, possibilitando a identificação de genótipos portadores de características de interesse agronômico. Vinte e quatro acessos de acerola, pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Estadual de Londrina, foram analisados, usando marcadores RAPD (Random amplified Polymorphic DNA) e obtidos com iniciadores (primers) de seqüência simples repetidas (SSRs). Um total de 164 e 73 marcadores foram obtidos com primers de RAPD e SSR, respectivamente. Os marcadores obtidos foram analisados, usando o método de agrupamentos UPGMA. A análise comparativa dos dendrogramas gerados com os primers de RAPD e com os primers SSR mostrou que, enquanto alguns acessos se associaram em grupos diferentes, outros apresentaram a mesma associação. Entretanto, maior polimorfismo entre acessos foi detectado com os primers de RAPD. A análise dos resultados revelou a alta variabilidade contida na coleção, permitindo associar o grau de similaridade genética, obtido por marcadores de DNA, com caracteres morfológicos compartilhados entre os acessos
Disciplines: Agrociencias,
Biología
Keyword: Frutales,
Biología molecular,
Malpighia emarginata,
Variabilidad genética,
Marcadores moleculares,
Polimorfismo
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Fruit trees,
Molecular biology,
Malpighia emarginata,
Genetic variability,
Molecular markers,
Polymorphism
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