| Journal: | Revista brasileira de epidemiologia |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000328149 |
| ISSN: | 1415-790X |
| Authors: | Joly, Marcel1 Pinto, Jose Mauricio2 |
| Institutions: | 1Universidade de Sao Paulo, Escola Politecnica, Sao Paulo. Brasil 2Polytechnic University, Othmer Department of Chemical and Biological Sciences and Engineering, Brooklyn, Nueva York. Estados Unidos de América |
| Year: | 2010 |
| Season: | Jun |
| Volumen: | 13 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 199-211 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Portugués |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Analítico, descriptivo |
| English abstract | The mathematical modeling of the process of generation of HIV-1 strains that present the syncytium-inducing phenotype during the asymptomatic and clinical AIDS phases is proposed and discussed in this paper. These strains may utilize exclusively CXCR4 (X4 strains) or not (R5X4 strains or dual-tropic). The experimental basis of Shankarappa et al. (J Virol 1999; 73(2): 10489-502,) is used as a reference for the generation and parameter estimation of the phenomenological models. In this study, different mathematical models for the phenotypical evolution of HIV-1 in terms of the retroviral ability to induce syncytium formation are proposed, tested and discussed. Better adherence to experimental results is verified when reversibility between the SI and NSI phenotypes is considered. Moreover, better alignment to in-vivo dynamics is observed if time-dependent functions are assumed to model the mutation rate among the R5, R5X4 and X4 strains of HIV-1 |
| Portuguese abstract | É proposta e discutida neste trabalho a modelagem matemática do processo de geração de variantes do vírus da imunodeficiência humana do tipo 1 que apresentam o fenótipo indutor de sincício durante as fases assintomática e AIDS clínica. Tais variantes podem fazer uso de CXCR4 exclusivamente (variantes X4) ou não (variantes R5X4 ou dual-trópicas). A base experimental de Shankarappa et al. (J Virol 1999; 73(2): 10489-502) é empregada como referência para derivação e calibração paramétrica de modelos fenomenológicos. Neste artigo, diferentes modelos matemáticos de evolução fenotípica do HIV-1, em termos da habilidade retroviral de induzir a formação de sincício, são propostos, testados e discutidos. Melhor aderência a resultados experimentais é verificada quando é considerada a reversibilidade entre fenótipos SI e NSI. Em adição, maior alinhamento à dinâmica in-vivo é observada se funções dependentes do tempo são admitidas para modelar a taxa de mutação entre variantes R5, R5X4 e X4 do HIV-1 |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Microbiología, Virus, Variación genética, Fenotipos, Modelos matemáticos, VIH, SIDA |
| Keyword: | Medicine, Microbiology, Virus, Genetic variation, Phenotypes, Mathematical models, HIV, AIDS |
| Full text: | Texto completo (Ver HTML) |
