Genetic diversity of native avocado in Nayarit, Mexico, determined by ISSRs



Document title: Genetic diversity of native avocado in Nayarit, Mexico, determined by ISSRs
Journal: Corpoica ciencia y tecnología agropecuaria (Bogotá)
Database:
System number: 000532910
ISSN: 0122-8706
Authors: 1
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Institutions: 1Universidad Autónoma de Nayarit, México
Year:
Season: Ene-Abr
Volumen: 22
Number: 1
Country: Colombia
Language: Español, inglés
Spanish abstract Los frutos de aguacate son nutritivos y de gran aceptación para su consumo en fresco. México es uno de los países con mayor producción y consumo de aguacate a nivel mundial. Las condiciones geográficas y edafoclimáticas de Nayarit, México, han sido idóneas para la reproducción del género Persea, por lo que existe un gran acervo genético del aguacate. El objetivo fue analizar la diversidad genética de Persea americana criollo del estado de Nayarit con los marcadores genéticos ISSR que son altamente polimórficos. Se recolectaron 43 materiales de aguacate criollo en cinco municipios de Nayarit, México. El nivel de diversidad genética detectado fue del 64 %, mientras que el análisis molecular de varianza indicó que la mayor variación se encuentra dentro de las poblaciones (82 %). La distancia genética de Nei y Li (Dice) agruparon los genotipos entre grupos de acuerdo con las distancias genéticas y se observó que la agrupación en la mayoría de los nodos estuvo asociada a la situación geográfica o climática. La información generada de esta investigación puede ser útil para construir estrategias de conservación y manejo del cultivo.
English abstract Avocado fruits are nutritious and highly accepted for fresh consumption. Mexico is one of the world’s largest producers and consumers of avocado. The geographical and edaphoclimatic conditions of Nayarit, Mexico, have been ideal for reproducing the genus Persea, hence the large avocado gene pool. This research analyzes the genetic diversity of native Persea americana from Nayarit using the highly polymorphic ISSRs genetic markers. We collected 43 samples of native avocado from five municipalities in Nayarit. The level of genetic diversity detected was 64 %, and the analysis of molecular variance indicated that the most significant variation is within populations (82 %). Dice’s genetic distance clustered the genotypes among groups according to genetic distances, and the clusters were associated with geographical or climatic conditions. Therefore, the information generated by this research can be useful in developing crop conservation and management strategies.
Keyword: Condiciones edafoclimáticas,
Distancia genética,
Genotipos,
Marcadores genéticos,
Persea americana
Keyword: Edaphoclimatic conditions,
Genetic distance,
Genetic markers,
Genotypes,
Persea americana
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