| Journal: | Ciencias marinas |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000403120 |
| ISSN: | 0185-3880 |
| Authors: | Pérez Enríquez, Ricardo1 Max-Aguilar, Adriana1 |
| Institutions: | 1Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S.C., La Paz, Baja California Sur. México |
| Year: | 2016 |
| Season: | Dic |
| Volumen: | 42 |
| Number: | 4 |
| Pages: | 227–235-227–235 |
| Country: | México |
| Language: | Español, inglés |
| Document type: | Nota breve o noticia |
| Approach: | Analítico, descriptivo |
| Spanish abstract | El mejoramiento genético en el camarón cultivado es de amplio interés para incremen tar la productividad. La evaluación de parámetros genéticos (e.g., he redabilidad, interacción entre genotipo y ambiente , endogamia) y el diseño de planes de apareamie nto son elementos necesarios para el mejoramiento genético. La rastreab ilidad del pedigrí con marcadores genéticos es importante para e stos objetivos. El objetivo de este trabajo fue comparar el desempeño de 2 paneles de marcadores genéticos (microsa télites y polimo rfismos de n ucleótido sencillo [SNP]) para rast rear el pedigrí en una pobl ación de camarón blanco ( Litopenaeus vannamei ) de cultivo. Se determ inó el pedigrí de la progenie de 81 familias de herma nos completos mediante el uso de microsatélites y SNP como marcadores genéticos. Un panel de 76 SNP probó tener un mejor desempeño que los mi crosatélites para la asi gnación de parentesco, obtenié ndose un 94–96% de asignación en una muestra de la progenie ( n = 192). Un número mínimo de 50 SNP con una proporción de 60% de loci con una frecuencia al élica mínima de 0.3 es adecuado para una asignación exitosa de pedigrí. Se sugiere ut ilizar los marcadores SNP para determinar el parentesco de la progenie de camarón proveniente de padres conocidos |
| English abstract | To increase productivity, genetic improve ment in cultivated shrimp is of much interest. Evaluation of genetic parameters (e.g., heritability, genotype –environment interaction, inbreedi ng) and the design of appropriate breeding plans are necessary st eps towards genetic improvement. Pedi gree traceability by genetic markers is relevant to these objectives. The aim of this study was to compare the performance of 2 genetic marker panels (microsatellites and single nucleotide polymorphisms [SNPs]) for pedigree traceability o f a cultivated stock of whiteleg shrimp ( Litopenaeus vannamei ). Pedigree of a stock from 81 full-sib families reared in a common environment was assessed with microsatellites and SNPs as genetic markers. Th e panel of 76 SNPs performed better than microsatellites, allowing 94–96% o f parentage assignment of the tested progeny ( n = 192). A minimum number of 50 SNPs with a proporti on of 60% loci with a mi nimum allele frequency of 0.3 is suitable for successful pedigree assignment. SNP markers are suggested for confidently testing the pedigree of shrimp fr om known parental broodstock |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Crustáceos, Genética, Litopenaeus vannamei, Camarón blanco, Cultivo de camarón, Parentesco, Marcadores genéticos, Probabilidad, Microsatélites, Polimorfismo |
| Keyword: | Biology, Crustaceans, Genetics, Litopenaeus vannamei, White shrimp, Shrimp culture, Parentage, Genetic markers, Probability, Microsatellites, Polymorphism |
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