| Journal: | Ciencias marinas |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000450882 |
| ISSN: | 0185-3880 |
| Authors: | Vargas Peralta, Carmen E1 Farfán, Claudia1 Lafarga de la Cruz, Fabiola1 Barón Sevilla, Benjamín1 Río Portilla, Miguel A. del1 |
| Institutions: | 1Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Departamento de Acuicultura, Ensenada, Baja California. México |
| Year: | 2020 |
| Season: | Dic |
| Volumen: | 46 |
| Number: | 4 |
| Pages: | 297-306 |
| Country: | México |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | El lenguado de California, Paralichthys californicus, es una especie de pez plano con un alto valor econónico debido a su tamaño y a la calidad de su carne. En este trabajo se presenta el genoma mitocondrial completo de P. californicus. Se extrajo ADN total de tejido muscular y se secuenció utilizando la plataforma Illumina. Las lecturas obtenidas se limpiaron, se recortaron, se ensamblaron de novo y se anotaron. El mitogenoma del lenguado de California tiene una logitud de 16,858 pb (número de acceso del GenBank: MT859134) y contiene 13 genes codificadores de proteínas, 22 ARNt, 2 ARNr y la región control. El mitogenoma de P. californicus fue más similar al de Paralichthys olivaceus que a mitogenomas de otros peces planos, en concordancia con su distribución geográfica. La información aquí presentada incrementa el conocimiento del lenguado de California, el cual no solo es una especie de importancia económica, sino también un recurso socioeconómico relevante para la pesquería y la acuicultura de California, EUA, y de Baja California, México |
| English abstract | The California halibut, Paralichthys californicus, is a highly priced flatfish because of its size and meat quality. This work pres ents the complete mitochondrial genome of P. californicus. Total DNA from muscle tissue was extracted and sequenced using the Illumina plat form. Reads were cleaned, trimmed, assembled de novo, and annotated. The California halibut mitogenome is 16,858 bp in length (GenBank accession number: MT859134), containing 13 protein-coding genes, 22 tRNAs, 2 rRNAs, and the control region. P. californicus mitogenome was most similar to Paralichthys olivaceus than to other flatfish mitogenomes, in agreement with their geographic distribution. This informa tion deepens the knowledge of the California halibut, which is not only ecologically important, but also a socioeconomically relevant resource for fishery and aquaculture in California, USA, and Baja California, Mexico |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Peces, Genética, Biología celular, Paralichthys californicus, Lenguado, Mitocondria |
| Keyword: | Fish, Genetics, Cell biology, Paralichthys californicus, Halibut, Mitochondria |
| Full text: | Texto completo (Ver HTML) Texto completo (Ver PDF) |
