Genetic variation among and within tritipyrum (Thinopyrum bessarabicum x Triticum durum) lines using PCR-based molecular markers



Document title: Genetic variation among and within tritipyrum (Thinopyrum bessarabicum x Triticum durum) lines using PCR-based molecular markers
Journal: Ciencia e investigación agraria
Database: PERIÓDICA
System number: 000358943
ISSN: 0304-5609
Authors: 1
1
2
Institutions: 1University of Zabol, Faculty of Agriculture, Zabol. Irán
2Shahid Bahonar Universty, Faculty of Agriculture, Kermán. Irán
Year:
Season: Ene-Abr
Volumen: 38
Number: 1
Pages: 127-135
Country: Chile
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental
Spanish abstract Las líneas primarias hexaploides de tritipyrum son anfiploides entre Triticum durum y Thinopyrum bessarabicum, cuyas semillas pueden ser plantadas en, al menos, 250 mM de NaCl. Se investigó la variación genética dentro y entre las 14 líneas de tritipyrum primaria, por medio de 2 oligos aleatorios y 6 semi-aleatorios que producen amplicones de ADN claro y reproducible. Los valores medios de la diversidad génica de Nei (h) y los índices de Shannon (I) fueron 0,115 y 0,178, respectivamente. Estos resultados indican poca variación dentro de las líneas tritipyrum primaria, lo que probablemente esté relacionado con el cromosoma imparcial y aneuploidía parcial. La diversidad genética total (HT) y la diversidad genética dentro de las líneas (SA) fueron 0,2114 y 0,1156, respectivamente. El coeficiente de diferenciación genética (GST) fue 0,4534. El AMOVA mostró diferencias genéticas altamente significativa (P < 0,001) entre las líneas. De la diversidad genética total, 51,54%, es atribuible a las 14 líneas tritipyrum y 48,16% a las diferencias dentro de las líneas. El índice de fijación (FST) fue 0,4815. La distancia genética calculada en base a las frecuencias alélicas entre las líneas, flctuó entre 0,064 y 0,226, con una media de 0,1156. La agrupación de las poblaciones sobre la base de UPGMA y la diversidad genética de Nei, indican una similitud genética entre algunas poblaciones. La mayor distancia genética se produjo entre el grupo POP6 con las poblaciones ubicadas en el grupo III. De acuerdo con la alta distancia genética de esta línea con las líneas ubicadas en el grupo III, se podría utilizar estos resultados en programas de mejoramiento y cruzamiento, con el fin de mejoramiento de la nueva planta tritipyrum
English abstract Primary hexaploid tritipyrum lines are amphiploids between Triticum durum and Thinopyrum bessarabicum, which can set seed in at least 250 mM NaCl. Genetic variation within and among 14 lines of primary tritipyrum were investigated by using 2 random and 6 semi random primers that produced clear and reproducible DNA amplicons. Average values for Nei's gene diversity (h) and Shannon indices (I) were 0.115 and 0.178, respectively. These results indicated low variation within primary tritipyrum lines, probably related to unbiased chromosome and partial aneuploidy. Total genetic diversity (Ht) and gene diversity within lines (Hs) were 0.2114 and 0.1156, respectively. The coefficient of genetic differentiation (Gst) was equal to 0.4534. AMOVA showed highly significant (P<0.001) genetic differences among lines. From the total genetic diversity, 51.54% is attributable to 14 tritipyrum lines and 48.16% to differences within lines. Fixation index (FST) was 0.4815. Genetic distance, calculated on the basis of allele frequencies among lines, ranged from 0.064 to 0.226 with an average of 0.1156. Grouping of populations based on UPGMA and Nei's gene diversity are indications of genetic similarity between some populations. Pop6 and populations located in group III had the highest genetic distance. These results could be used in breeding and cross programs to breed a new tritipyrum plant
Disciplines: Agrociencias
Keyword: Genética,
Gramática,
Aneuploidía,
Variación genética,
Cebadores aleatorios,
Cebadores semi aliatorios,
Lineas tritipyrum
Keyword: Agricultural sciences,
Gramineae,
Genetics,
Aneuploidy,
Genetic variation,
Random primers,
Semi random primers,
Tritipyrum lines,
Grammar
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