Identification of methyl jasmonate-responsive genes in sugarcane using cDNA arrays



Document title: Identification of methyl jasmonate-responsive genes in sugarcane using cDNA arrays
Journal: Brazilian journal of plant physiology
Database: PERIÓDICA
System number: 000276192
ISSN: 1677-0420
Authors: 1


2
Institutions: 1Universidade Estadual de Campinas, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genetica, Campinas, Sao Paulo. Brasil
2Centro de Tecnologia Canavieira, Piracicaba, Sao Paulo. Brasil
Year:
Season: Ene-Mar
Volumen: 17
Number: 1
Pages: 173-180
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
English abstract Jasmonic acid (JA) and its ester methyl jasmonate (MeJA) are linolenic acid-derived signaling molecules involved in plant development and stress responses. MeJA regulates gene expression at transcription, RNA processing and translation. We investigated the changes in gene expression in sugarcane leaves exposed to MeJA using cDNA arrays. Total RNA isolated at 0, 0.5, 1, 3, 6, and 12 h following MeJA treatment was labeled with alpha-33P-dCTP and hybridized to nylon filters containing 1,536 cDNA clones. A significant increase in gene expression in response to MeJA was detected for both novel and well known stress-related genes, while genes participating in photosynthesis and carbohydrate assimilation were down-regulated. Searches for conserved domains in unknown proteins and digital mRNA expression profile analysis revealed putative new stress-related proteins up-regulated by MeJA and the tissues where the MeJA-regulated genes are preferably expressed
Portuguese abstract O ácido jasmônico (JA) e seu éster metil-jasmonato (MeJA) são moléculas sinalizadoras derivadas do ácido linolênico e estão envolvidas no desenvolvimento da planta e na resposta aos estresses. MeJA regula a expressão gênica ao nível transcricional, do processamento do RNA e da tradução. Investigamos as mudanças na expressão gênica em folhas de cana-de-açúcar expostas ao MeJA usando arranjos de cDNA. O RNA total isolado a 0, 0,5, 1, 3, 6 e 12 horas após o tratamento com MeJA foi utilizado para a síntese de sondas contendo alfa-33P-dCTP, as quais foram, posteriormente, hibridizadas em membranas de náilon contendo 1.536 clones de cDNA. Um aumento significativo na expressão gênica em resposta ao MeJA foi detectado em genes que respondem a estresses e também em genes com função desconhecida, enquanto os genes que participam da fotossíntese e da assimilação de carboidrato foram reprimidos. A busca por domínios conservados em proteínas desconhecidas e a análise digital do perfil de expressão de mRNA revelaram possíveis proteínas novas relacionadas a estresses induzidas por MeJA e os tecidos onde os genes regulados por MeJA são preferivelmente expressos
Disciplines: Agrociencias,
Química
Keyword: Gramíneas,
Bioquímica,
Genética,
ADN,
Expresión génica,
Jasmonato de metilo,
Caña de azúcar
Keyword: Agricultural sciences,
Chemistry,
Gramineae,
Biochemistry,
Sugar cane,
DNA,
Methyl jasmonate,
Gene expression,
Genetics
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