| Journal: | Brazilian journal of microbiology |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000291093 |
| ISSN: | 1517-8382 |
| Authors: | Gibotti, Adriana1 Tanaka, Tania L2 Oliveira, Valeria R Taddei, Carla R Martinez, Marina B |
| Institutions: | 1Universidade de Sao Paulo, Instituto de Ciencias Biomedicas, Sao Paulo. Brasil 2Universidade de Sao Paulo, Faculdade de Ciencias Farmaceuticas, Sao Paulo. Brasil |
| Year: | 2004 |
| Season: | Ene-Jun |
| Volumen: | 35 |
| Number: | 1-2 |
| Pages: | 74-80 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental |
| English abstract | In this study, polymorphism in ipa genes was found in five out of nine EIEC serotypes studied. When SalI and HindII were used in RFLP-PCR assays many EIEC serotypes showed polymorphism in ipaB and ipaD. On the other hand, no polymorphism was observed in ipaA and ipaC in these strains. The polymorphism present in EIEC strains is serotype-dependent, since restriction patterns were conserved amongst strains belonging to the same serotype. When IpaB deduced amino acid sequences of S. flexneri M90T and FBC124-13 were compared, ten amino acids changes could be observed mainly in the amino-terminal region. The deduced EIEC IpaD amino-acid sequence presented 91% similarity with the Shigella strain. In this case, amino acid changes were spread out through the whole structure, except in the carboxyl-terminal region |
| Portuguese abstract | No presente estudo, foi encontrado polimorfismo no gene ipa em cinco sorotipos de EIEC, de nove estudados. Quando enzimas de restrição SalI e HindII foram utilizadas no ensaio de PCR-RFLP, amostras de EIEC apresentaram polimorfismo em ipaB e ipaD. Por outro lado, não foram observados polimorfismos nos genes ipaA e ipaC nestas cepas, quando diversas enzimas de restrição foram utilizadas. O polimorfismo presente em cepas de EIEC é sorotipo-dependente, uma vez que os padrões de restrição foram conservados entre as cepas pertencentes ao mesmo sorotipo. Quando a seqüência deduzida de aminoácidos de IpaB de S. flexneri M90T e FBC124-13 foram comparadas, mudanças foram observadas em dez aminoácidos na região amino-terminal. A seqüência deduzida de aminoácidos de IpaD de EIEC apresentou similaridade de 91% com a cepa de Shigella. Neste caso, mudanças de aminoácidos ocorreram em toda a estrutura da molécula de IpaD, exceto na região carboxi-terminal |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Genética, Parasitología, Escherichia coli, Biología molecular, gene Ipa, PCR-RFLP, Polimorfismo |
| Keyword: | Medicine, Genetics, Parasitology, Escherichia coli, Polymorphism, PCR-RFLP, Ipa gene, Molecular biology |
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