| Journal: | Brazilian journal of microbiology |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000291107 |
| ISSN: | 1517-8382 |
| Authors: | Cerqueira, Daniela Marreco1 Ramalho, Eduardo Dias Oliveira, Claudiner Pereira Silva, Ruiter Roberto2 Franchini, Miriam Felipe, Maria Sueli Soares Martins, Cláudia Renata Fernandes |
| Institutions: | 1Universidade de Brasilia, Instituto de Biologia, Brasilia, Distrito Federal. Brasil 2Laboratorio Central de Saude Publica, Brasilia, Distrito Federal. Brasil |
| Year: | 2004 |
| Season: | Jul-Sep |
| Volumen: | 35 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 187-192 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental |
| English abstract | The detection of polymorphisms associated to HIV-1 drug-resistance and genetic subtypes is important for the control and treatment of HIV-1 disease. Drug pressure selects resistant variants that carry mutations in the viral reverse transcriptase (RT) and protease (PR) genes. For a contribution to the public health authorities in planning the availability of therapeutic treatment, we therefore described the genetic variability, the prevalence of mutations associated to drug resistance and the antiretroviral resistance profile in HIV-1 isolates from infected individuals in Central Brazil. Nineteen HIV-1 RNA samples from a Public Health Laboratory of the Federal District were reversely transcribed and cDNAs were amplified by nested PCR. One fragment of 297 bp coding the entire protease gene, and another of 647 bp, corresponding to the partial RT gene (codons 19-234), were obtained. Automated sequencing and BLAST analysis revealed the presence of 17 B and 2 F1 HIV-1 subtypes. The amino acid sequences were analyzed for the presence of resistance-associated mutations. A total of 6 PR mutations, 2 major and 4 accessory, and 8 RT mutations related to drug resistance were found. Our data suggest a high prevalence of HIV-1 B subtype in the studied population of Federal District as well as the presence of genetically-resistant strains in individuals failing treatment |
| Portuguese abstract | A detecção de polimorfismos do HIV-1 que estejam associados à resistência às drogas anti-retrovirais e aos subtipos genéticos é importante para o controle e tratamento da infecção pelo HIV-1. A pressão exercida pela terapia anti-retroviral seleciona variantes resistentes com mutações nos genes virais da transcriptase reversa (RT) e da protease (PR). Assim, visando contribuir com as autoridades de saúde pública na perspectiva de planejar a disponibilidade de um tratamento terapêutico, nós descrevemos a variabilidade genética e a prevalência de mutações associadas à resistência aos anti-retrovirais em isolados do HIV-1 de indivíduos infectados no Distrito Federal. Dezenove amostras de RNA do HIV-1 provenientes de um laboratório de Saúde Pública do Distrito Federal foram transcritas reversamente e os cDNAs obtidos foram amplificados por nested PCR. Um fragmento de 297 pb correspondente ao gene completo da protease e outro de 647 pb, correspondente à parte do gene da transcriptase reversa (códons 19 a 234), foram obtidos. O seqüenciamento automático e análise de homologia revelaram a presença de 17 subtipos B e 2 subtipos F1 do HIV-1. As seqüências de aminoácidos foram analisadas com relação à presença de mutações associadas à resistência. Um total de 6 mutações na PR, 2 primárias e 4 secundárias e 8 mutações relacionadas à resistência na RT foram encontradas. Nossos dados sugerem uma elevada prevalência do subtipo B do HIV-1 na população estudada do Distrito Federal, assim como a presença de variantes virais geneticamente resistentes em indivíduos que não respondem ao tratamento |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Virus, Genética, HIV-1, Brasil, Resistencia, Antirretrovirales |
| Keyword: | Medicine, Virus, Genetics, HIV-1, Resistance, Antiretroviral drugs, Brazil |
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