Molecular epidemiology of the human group A rotavirus in the Paraná State, Brazil



Document title: Molecular epidemiology of the human group A rotavirus in the Paraná State, Brazil
Journal: Brazilian archives of biology and technology
Database: PERIÓDICA
System number: 000331992
ISSN: 1516-8913
Authors: 1
2
3
4
2
Institutions: 1Universidade Federal do Parana, Programa de Pos-graduacao em Microbiologia, Parasitologia e Patologia, Curitiba, Parana. Brasil
2Universidade Estadual de Londrina, Londrina, Parana. Brasil
3Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro. Brasil
4Laboratorio Central do Estado do Parana, Curitiba, Parana. Brasil
Year:
Season: Mar-Abr
Volumen: 51
Number: 2
Pages: 287-294
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
English abstract From January/2000 to December/2003, 550 diarrheic fecal samples from the children and adults were collected in several geographical regions of Paraná State, Brazil. The enzyme immunoassay showed 120 (21.8%) samples positive for the group A rotaviruses. One hundred and fourteen samples were genotyped by multiplex-nested-PCR assay. The highest frequency (77.5%) of the positive samples (n=93) was observed in the children under 5 years old. Rotavirus diarrhea was more frequent in the cold and dry seasons of the four evaluated years. The most frequent genotypes were: G1 (50.9%), G4 (9.6%), G9 (7.0%), G2 (1.7%), G3 (0.9%), P[ 8] (71.9%), and P[ 4] (3.5%). The P[ 8] G1 (46.5%) and P[ 8] G4 (9.6%) were the main combinations found to P and G genotypes. The mixed infections, characterized by the rotaviruses with more than one genotype G or P, and nontypeable rotavirus were observed in 8.8, 3.5, and 16.7% of the samples, respectively. The identification of the G9 genotype in the rotavirus strains tested along the four years of studies ratifies the emergency of this genotype also in Paraná State, South region of Brazil, as the worldwide
Portuguese abstract No período de janeiro de 2000 a dezembro de 2003 foram colhidas, em várias regiões geográficas do Estado do Paraná, 550 amostras fecais de crianças e adultos com quadro clínico de diarréia aguda. Por meio de ensaio imunoenzimático comercial, 120 (21,8%) amostras foram positivas para o rotavírus grupo A. Dessas, 114 amostras foram genotipadas por meio da multiplex-nested-PCR. A maior freqüência (77,5%) de amostras positivas (n=93) foi observada em crianças menores de cinco anos de idade. A maior concentração de casos positivos para o rotavírus ocorreu nos meses frios e secos dos quatro anos avaliados. Os genotipos de maior ocorrência foram: G1 (50,9%), G4 (9,6%), G9 (7,0%), G2 (1,7%), G3 (0,9%), P[ 8] (71,9%) e P[ 4] (3,5%). P[ 8] G1 (46,5%) e P[ 8] G4 (9,6%) foram as associações de genotipos P e G mais encontradas. Infecções mistas, caracterizadas por estirpes de rotavírus com mais de um genotipo G, P e amostras não-genotipadas foram observadas, respectivamente, em 8,8, 3,5 e em 16,7% das amostras. De forma semelhante ao que vem ocorrendo em várias partes do mundo a identificação do genotipo G9 em estirpes de rotavírus identificadas ao longo dos quatro anos do estudo ratifica a emergência desse genotipo também no Estado do Paraná, Brasil
Disciplines: Medicina
Keyword: Microbiología,
Rotavirus,
Diarrea,
Genotipos,
Epidemiología molecular
Keyword: Medicine,
Microbiology,
Rotavirus,
Diarrhea,
Genotypes,
Molecular epidemiology
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