Assessing the genetic structure of Oryza glumaepatula populations with isozyme markers



Document title: Assessing the genetic structure of Oryza glumaepatula populations with isozyme markers
Journal: Brazilian archives of biology and technology
Database: PERIÓDICA
System number: 000330709
ISSN: 1516-8913
Authors: 1
1
2
1
1
Institutions: 1Universidade de Sao Paulo, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", Piracicaba, Sao Paulo. Brasil
2Universidade Federal do Para, Altamira, Para. Brasil
Year:
Season: Sep-Oct
Volumen: 51
Number: 5
Pages: 873-882
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
English abstract To assess the genetic diversity and genetic structure parameters, nine populations of Oryza glumaepatula from the Amazon biome, four from the Pantanal biome, and one collected at Rio Xingu, Mato Grosso, totaling 14 populations and 333 individuals were studied with isozyme markers. Six loci were evaluated showing a moderate allozyme variability (A = 1.21, P = 20.7%, Ho = 0.005, He = 0.060). The populations from the Pantanal biome showed higher diversity levels than the Amazon biome. High genetic differentiation among the populations, expected for self-fertilizing species, was observed (FST=0.763), with lower differentiation found among the Pantanal populations (FST=0.501). The average apparent outcrossing rate was higher for the Pantanal populations (ta = 0.092) than for the Amazonian populations (ta = 0.003), while the average for the 14 populations was 0.047, in accordance with a self-fertilization mating system
Portuguese abstract Utilizando marcadores isoenzimáticos, foram avaliadas nove populações de Oryza glumaepatula originárias da Amazônia, quatro do bioma do Pantanal, e uma coletada no Rio Xingu, Mato Grosso, totalizando 14 populações e 333 indivíduos, com o objetivo de avaliar a diversidade genética e a estrutura genética dessas populações. Seis locos foram avaliados, mostrando variabilidade alozímica moderada (A = 1.21, P = 20.7%, Ho = 0.005, He = 0.060). As populações do bioma Pantanal apresentaram níveis de diversidade mais altos que as da Amazônia. Alta diferenciação genética entre populações, esperada para espécies autógamas, foi observada (FST=0.763), com menor diferenciação encontrada entre populações do Pantanal (FST=0.501). A taxa média de cruzamento aparente foi maior para as populações do Pantanal (ta = 0.092) que da Amazônia (ta = 0.003), enquanto que a taxa media para as 14 populações foi 0.047, em concordância com o sistema reprodutivo por autogamia
Disciplines: Biología
Keyword: Angiospermas,
Genética,
Diversidad genética,
Marcadores genéticos,
Isoenzimas,
Genética de poblaciones,
Oryza glumaepatula
Keyword: Biology,
Angiosperms,
Genetics,
Genetic diversity,
Genetic markers,
Isozymes,
Population genetics,
Oryza glumaepatula
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