Evaluación de amplificación cruzada de microsatélites para estudios de genética poblacional del cazón antillano Rhizoprionodon porosus (Carcharhinidae) en el Caribe colombiano



Document title: Evaluación de amplificación cruzada de microsatélites para estudios de genética poblacional del cazón antillano Rhizoprionodon porosus (Carcharhinidae) en el Caribe colombiano
Journal: Boletín de investigaciones marinas y costeras
Database: PERIÓDICA
System number: 000432060
ISSN: 0122-9761
Authors: 1
2
1
Institutions: 1Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras, Santa Marta, Magdalena. Colombia
2Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Medellín, Antioquia. Colombia
Year:
Season: Ene-Jun
Volumen: 45
Number: 1
Country: Colombia
Language: Español
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract El tiburón cazón antillano, Rhizoprionodon porosus, constituye un recurso importante para pesquerías artesanales de pequeña escala; es uno de los tiburones costeros más abundantes dentro de su ámbito de distribución y desempeña una importante función como depredador en los ecosistemas marino-costeros. Por sus hábitos costeros, la especie es susceptible de sufrir extracción intensiva, especialmente en estados juveniles. Para darle un manejo apropiado y conservar las poblaciones explotadas de R. porosus se necesita conocer la diversidad genética y la estructura de las poblaciones dentro de sus rangos de distribución. En este estudio se probó la habilidad de cebadores heterólogos desarrollados para otras especies de tiburones de la familia Carcharhinidae para amplificar marcadores nucleares microsatélites en R. porosus (amplificación cruzada). La variación de la frecuencia alélica de genotipos de cuatro loci microsatélites sirvió para evaluar la estructura genética de R. porosus en siete localidades de cuatro departamentos del Caribe colombiano. El análisis de varianza molecular Amova y análisis de estructura poblacional mediante el estadístico Фst para las frecuencias genotípicas, indican que hay diferenciación genética baja pero significativa entre R. porosus provenientes de los departamentos analizados (Фst (3,165)= 0.002; p = 0.000). Además, el análisis pareado indica que existe una diferenciación genética significativa entre el cazón antillano de La Guajira y las demás muestras analizadas (todos los p = 0.000). La información obtenida ayuda a entender la dinámica de las poblaciones naturales del cazón antillano, sirve de línea base para la formulación y desarrollo de estrategias de conservación y manejo de este recurso pesquero; sin embargo, dado el bajo número de loci heterólogos útiles para estudios genético poblacionales, se deben enfocar los esfuerzos de investigación en el desarrollo de marcadores espe
English abstract The Caribbean sharpnose shark, Rhizoprionodon porosus is an important resource for artisanal small-scale fisheries. It is one of the most abundant coastal sharks within its distribution range, and plays an important role as a predator in coastal marine ecosystems. For its coastal habits, it is susceptible to intensive extraction, especially the juveniles. To accomplish proper management and conservation of exploited Rhizoprionodon populations, knowledge about its genetic diversity and its population structure within their distribution range is needed. The ability of heterologous primers developed for other requiem sharks to amplify microsatellite molecular markers in R. porosus was tested in this study (cross amplification). The change in allele frequency of four microsatellite loci served to assess the genetic structure of R. porosus in the Colombian Caribbean. Analysis of molecular variance Amova and population structure analysis using the Фst statistical of genotype frequencies indicate low but significant genetic differentiation among R. porosus from the departments analyzed (Фst (3,165) = 0.002; p = 0.000). Besides, the analysis of pairs of departments indicates that there is significant genetic differentiation among La Guajira and the other samples analyzed of the Antillean sharpnose shark (all p values = 0.000). The information obtained helps to understand the dynamics of natural populations of the Caribbean sharpnose shark, serving as a baseline for the formulation, development of conservation strategies and management of this fishery resource; however, due the low number of heterologous loci useful for population genetics studies, research efforts on the development of specific markers for the species should be done for further population genetic studies of this species
Disciplines: Biología
Keyword: Peces,
Genética,
Rhizoprionodon porosus,
Carcharhinidae,
Estructura genética,
Microsatélites,
Amplificación cruzada
Keyword: Fish,
Genetics,
Rhizoprionodon porosus,
Carcharhinidae,
Genetic structure,
Microsatellites,
Cross amplification
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