| Journal: | Anais da Academia Brasileira de Ciencias |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000393742 |
| ISSN: | 0001-3765 |
| Authors: | Santos, Paulo C.C. dos1 Lopes, Helder F.S2 Alcalde, Rosana1 Gonsalez, Claudio R1 Abe, Jair M2 Lopez, Luis F1 |
| Institutions: | 1Universidade de Sao Paulo, Faculdade de Medicina, Sao Paulo. Brasil 2Universidade de Sao Paulo, Instituto de Estudos Avancados, Sao Paulo. Brasil |
| Year: | 2016 |
| Season: | Mar |
| Volumen: | 88 |
| Number: | 1 |
| Pages: | 323-334 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| English abstract | The high variability of HIV-1 as well as the lack of efficient repair mechanisms during the stages of viral replication, contribute to the rapid emergence of HIV-1 strains resistant to antiretroviral drugs. The selective pressure exerted by the drug leads to fixation of mutations capable of imparting varying degrees of resistance. The presence of these mutations is one of the most important factors in the failure of therapeutic response to medications. Thus, it is of critical to understand the resistance patterns and mechanisms associated with them, allowing the choice of an appropriate therapeutic scheme, which considers the frequency, and other characteristics of mutations. Utilizing Paraconsistents Artificial Neural Networks, seated in Paraconsistent Annotated Logic Et which has the capability of measuring uncertainties and inconsistencies, we have achieved levels of agreement above 90% when compared to the methodology proposed with the current methodology used to classify HIV-1 subtypes. The results demonstrate that Paraconsistents Artificial Neural Networks can serve as a promising tool of analysis |
| Portuguese abstract | A elevada variabilidade do HIV-1, bem como, a ausência de mecanismos eficientes de reparo durante os estágios da replicação viral, contribuem para a rápida emergência de cepas de HIV-1 resistentes aos antirretrovirais. A pressão seletiva exercida pelas drogas, leva à fixação de mutações capazes de conferir graus variados de resistência. A presença dessas mutações constitui um dos fatores mais importantes na falha da resposta terapêutica aos medicamentos. Assim, é de fundamental importância compreender os padrões de resistência e os mecanismos a eles associados, possibilitando a escolha de um esquema terapêutico apropriado que considere a frequência e outras características das mutações. Utilizando a Rede Neural Artificial Paraconsistente, assentada na Lógica Paraconsistente Anotada Et que tem a capacidade de mensurar incertezas e inconsistências, obtivemos níveis de concordância acima de 90% quando comparado à metodologia proposta com a metodologia atual empregada para classificar os subtipos do HIV-1. Os resultados obtidos demonstram que a Rede Neural Artificial Paraconsistente pode servir como ferramenta promissora de análise |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Virus, Redes neuronales artificiales, Genética, VIH-1, Terapia antirretroviral, Mutaciones, Replicación viral, Variabilidad genética, Genotipificación, Lógica paraconsistente |
| Keyword: | Medicine, Virus, Artificial neural networks, Genetics, HIV-1, Antiretroviral therapy, Mutations, Viral replication, Genetic variability, Genotyping, Paraconsistent logic |
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