| Journal: | Anais da Academia Brasileira de Ciencias |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000401255 |
| ISSN: | 0001-3765 |
| Authors: | Mondino, Eduardo Ariel1 Covacevich, Fernanda2 Studdert, Guillermo A3 Pimentel, Joao Pedro4 Berbara, Ricardo Luis Louro1 |
| Institutions: | 1Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Instituto de Agronomia, Seropedica, Rio de Janeiro. Brasil 2Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Unidad Integrada Balcarce, Balcarce, Buenos Aires. Argentina 3Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropedica, Rio de Janeiro. Brasil |
| Year: | 2015 |
| Season: | Jun |
| Volumen: | 87 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 691-697 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Nota breve o noticia |
| Approach: | Analítico, descriptivo |
| English abstract | We examined four strategies (Tris/EDTA, sodium dodecyl sulfate, Chelex 100 resin and cetyltrimethylammonium bromide -CTAB-) for extracting nucleic acid (DNA) from communities of nematodes. Nematodes were isolated from an agricultural area under different management of long-term crop rotation experiment from Argentina during three seasons. After DNA extraction, Polymerase Chain Reaction-amplifications were performed and considered as indicators of successful DNA extraction. The CTAB combined with proteinase K and phenol-chloroform-isoamyl alcohol was the unique successful method because positive amplifications were obtained by using both eukaryotic and nematode specific primers. This work could contribute to biodiversity studies of nematodes on agroecosystems |
| Portuguese abstract | Foram examinadas quatro estratégias (Tris / EDTA, dodecilsulfato de sódio, resina Chelex 100 e brometo de cetiltrimetilamónio -CTAB-) para a extração de ácido nucleico (DNA) das comunidades de nematóides. Os nematóides foram isolados a partir de uma área agrícola sob manejo diferente num experimento de rotação de culturas de longo prazo, durante três temporadas na Argentina. Após a extração de DNA, a reação em cadeia da polimerase e amplificações foram realizadas e consideradas como indicadoras da extração de DNA com sucesso. O CTAB combinada com proteinase K e álcool fenol-clorofórmioisoamílico foi o único método bem sucedido porque as amplificações positivas foram obtidas utilizando ambos os primers específicos para os eucariótas e nematóides. Este trabalho poderá contribuir para o estudo da biodiversidade de nematóides em agroecossistemas |
| Disciplines: | Química, Biología, Agrociencias |
| Keyword: | Bioquímica, Helmintos, Suelos, Agroecosistemas, Nemátodos, Extracción, Acidos nucléicos, Bromuro de cetyltrimethylammonio |
| Keyword: | Chemistry, Biology, Agricultural sciences, Biochemistry, Helminths, Soils, Agroecosystems, Nematodes, Extraction, Nucleic acids, Cetyltrimethylammonium bromide |
| Full text: | Texto completo (Ver PDF) |
