| Journal: | Anais da Academia Brasileira de Ciencias |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000399289 |
| ISSN: | 0001-3765 |
| Authors: | Vilhena, Milca B1 Franco, Monica R1 Schmidt, Daiana1 Carvalho, Giselle1 Azevedo, Ricardo A1 |
| Institutions: | 1Universidade de Sao Paulo, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", Piracicaba, Sao Paulo. Brasil |
| Year: | 2015 |
| Season: | Sep |
| Volumen: | 87 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 1853-1864 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| English abstract | Proteomics is an outstanding area in science whose increasing application has advanced to distinct purposes. A crucial aspect to achieve a good proteome resolution is the establishment of a methodology that results in the best quality and wide range representation of total proteins. Another important aspect is that in many studies, limited amounts of tissue and total protein in the tissue to be studied are found, making difficult the analysis. In order to test different parameters, combinations using minimum amount of tissue with 4 protocols for protein extraction from tomato (Solanum lycopersicum L.) leaves and roots were evaluated with special attention to their capacity for removing interferents and achieving suitable resolution in bidimensional gel electrophoresis, as well as satisfactory protein yield. Evaluation of the extraction protocols revealed large protein yield differences obtained for each one. TCA/acetone was shown to be the most efficient protocol, which allowed detection of 211 spots for leaves and 336 for roots using 500 µg of leaf protein and 800 µg of root protein per gel |
| Portuguese abstract | A proteômica é uma área incrível da ciência cujas apli cações vêm avançando para diversos propósitos. Um aspecto crucial para se alcançar boa resolução proteômica é o estabelecimento de uma metodologia que resulte na melhor qualidade e ampla representação das proteínas totais. Outro aspecto importante é que em muitos estudos quantidades limitadas de tecido e de proteínas totais no tecido a ser estudado são encontradas, tornando difícil a análise. Com o objetivo de testar diferentes parâmetros, combinações usando mínimas quantidades de tecido com 4 protocolos para extração protéica de folhas e raízes de tomateiro (Solanum lycopersicumL.) foram avaliadas com atenção especial para a capacidade de remover interferentes e atingir resolução adequada em eletroforese bidimensional, bem como rendimento satisfatório de proteínas. A avaliação dos protocolos de extração revelou grandes diferenças na quantidade de proteínas obtidas por cada um. O protocolo TCA/acetona mostrou ser o protocolo mais eficiente, que permitiu a detecção de 211 "spots" para folhas e 336 para raízes utilizando 500 µg de proteína de folhas e 800 µg de proteínas de raiz por gel |
| Disciplines: | Biología, Química, Agrociencias |
| Keyword: | Angiospermas, Bioquímica, Hortalizas, Proteínas, Extracción química, Electroforesis bidimensional, Análisis proteómico, Tomate, Lycopersicon esculentum |
| Keyword: | Biology, Chemistry, Agricultural sciences, Angiosperms, Biochemistry, Vegetables, Proteins, Chemical extraction, Bidimensional electrophoresis, Proteomic analysis, Tomato, Lycopersicon esculentum |
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