Uso da bioinformática na diferenciação molecular da Entamoeba histolytica e Entamoeba dispar



Document title: Uso da bioinformática na diferenciação molecular da Entamoeba histolytica e Entamoeba dispar
Journal: Acta scientiarum. Health science
Database: PERIÓDICA
System number: 000320062
ISSN: 1679-9291
Authors: 1
2



Institutions: 1Universidade Estadual de Maringa, Departamento de Zootecnia, Maringa, Parana. Brasil
2Universidade Estadual do Oeste do Parana, Departamento de Biologia, Cascavel, Parana. Brasil
Year:
Season: Jul-Dic
Volumen: 30
Number: 2
Pages: 101-106
Country: Brasil
Language: Portugués
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
English abstract Under microscopic conditions, the invasive Entamoeba histolytica is indistinguishable from the non-pathogenic species Entamoeba dispar. In this way, the present study was carried out to determine a molecular strategy for discriminating both species by the mechanisms of bioinformatics. The gene cysteine synthetase was considered for such a purpose by using the resources of the National Center for Biotechnology Information data bank in the search for similarities in the gene sequence. In this way, a primer pair was designed by the Web Primer program and the restriction enzyme TaqI was selected by the Web Cutter software program. The DNA fragment had a size of 809 bp before cutting, which is consistent with E. dispar. The gene fragment was partitioned in a first fragment with 255 bp and a second one with 554 bp, which is similar to the genetic characteristics of E. histolytica
Portuguese abstract Amebíase invasiva, causada por Entamoeba histolytica, é microscopicamente indistinguível da espécie não-patogênica Entamoeba dispar. Com auxílio de ferramentas de bioinformática, objetivou-se diferenciar Entamoeba histolytica e Entamoeba dispar por técnicas moleculares. A análise foi realizada a partir do banco de dados da National Center for Biotechnology Information; pela pesquisa de similaridade de sequências, elegeu-se o gene da cisteína sintase. Um par de primer foi desenhado (programa Web Primer) e foi selecionada a enzima de restrição TaqI (programa Web Cutter). Após a atuação da enzima, o fragmento foi dividido em dois, um com 255 pb e outro com 554 pb, padrão característico da E. histolytica. Na ausência de corte, o fragmento apresentou o tamanho de 809 pb, referente à E. dispar
Disciplines: Biología,
Química
Keyword: Protozoarios,
Taxonomía y sistemática,
Bioquímica,
Biotecnología,
Biología molecular,
Secuencia génica,
Análisis de secuencias,
Bioinformática,
Entamoeba histolytica,
Entamoeba dispar,
Taxonomía molecular
Keyword: Biology,
Chemistry,
Protozoa,
Taxonomy and systematics,
Biochemistry,
Molecular biology,
Gene sequence,
Sequence analysis,
Bioinformatics,
Entamoeba histolytica,
Entamoeba dispar,
Molecular taxonomy
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