Obtaining 5S rDNA molecular markers for native and invasive Cichla populations (Perciformes – Cichlidae), in Brazil



Document title: Obtaining 5S rDNA molecular markers for native and invasive Cichla populations (Perciformes – Cichlidae), in Brazil
Journal: Acta scientiarum. Biological sciences
Database: PERIÓDICA
System number: 000273870
ISSN: 1679-9283
Authors: 1

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Institutions: 1Centro Universitario de Maringa, Maringa, Parana. Brasil
2Universidade Estadual de Maringa, Departamento de Biologia Celular e Genetica, Maringa, Parana. Brasil
3Universidade Estadual de Maringa, Nucleo de Pesquisas em Limnologia, Ictiologia e Aquicultura, Maringa, Parana. Brasil
Year:
Season: Ene-Mar
Volumen: 30
Number: 1
Pages: 83-89
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
English abstract The 5S rDNA gene is informative and has high conservation rates along the eukaryotic genome, having unique hereditary characteristics. Molecular studies with the 5S rDNA gene have been carried out with several groups, including some species of fish, aiming at solving phylogenetic relationship problems, ancestral patterns and genetic diversity among groups in natural populations. Species of the Cichla genus, introduced in the upper Paraná river basin, present some genetic polymorphisms detected by RAPD and SPAR analyses. These species have been intercrossing and forming viable hybrids, with greater genetic variability. The objective of this work was to standardize the amplification methodology for the non-transcribed regions of 5S rDNA multigenic family of Cichla, and to obtain specific markers for parent species that could also be identified in the hybrids. Sixty-five specimens of Cichla collected from the upper Paraná river and Amazon basins were analyzed. Although molecular markers that could be useful in the identification of hybrids were not obtained, genetic molecular 5S rDNA species-specific markers for Cichla temensis that can be employed to identify of this species, as well population markers that can be useful in population genetic variability studies, were obtained
Portuguese abstract O gene DNAr 5S é informativo e possui altas taxas de conservação ao longo do genoma dos eucariotos, possuindo características únicas que são hereditárias. Estudos moleculares do gene DNAr 5S vem sendo realizados com diversos grupos, inclusive em algumas espécies de peixes, com o intuito de solucionar problemas de relações filogenéticas, padrão de ancestralidade e diversidade genética, entre grupos de populações naturais. Espécies do gênero Cichla, introduzidas na bacia do alto rio Paraná, apresentam polimorfismos genéticos, detectados por análise de RAPD e SPAR. Essas espécies estão intercruzando-se e formando híbridos viáveis, com maior variabilidade genética. O objetivo desse trabalho foi padronizar a metodologia de amplificação de regiões não-transcritas da família multigênica rDNA 5S de Cichla e obter marcadores específicos para as espécies parentais que pudessem, também, ser identificados nos híbridos. Foram analisados 65 espécimes de Cichla, das bacias do alto rio Paraná e Amazônica. Apesar de não se obter marcadores moleculares que pudessem ser úteis à identificação de híbridos, foram obtidos marcadores moleculares genéticos DNAr 5S espécie-específicos para Cichla temensis, que podem ser utilizados para identificação de exemplares dessa espécie e, também, marcadores populacionais, que podem ser úteis para estudos de variabilidade genética populacional
Disciplines: Biología,
Química
Keyword: Genética,
Peces,
Bioquímica,
Peces de agua dulce,
Especies introducidas,
Marcadores moleculares,
Cichla,
Cichlidae,
Brasil
Keyword: Biology,
Chemistry,
Fish,
Genetics,
Biochemistry,
Freshwater fish,
Introduced species,
Molecular markers,
Cichla,
Cichlidae,
Brazil
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