Population structure and impact of recurrent selection on popcorn using EST-SSR markers



Document title: Population structure and impact of recurrent selection on popcorn using EST-SSR markers
Journal: Acta scientiarum. Agronomy
Database: PERIÓDICA
System number: 000460160
ISSN: 1679-9275
Authors:
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Institutions: 1Universidade Estadual do Norte Fluminense, Centro de Ciencias e Tecnologia Agropecuaria, Campos dos Goytacazes, Rio de Janeiro. Brasil
Year:
Volumen: 40
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
English abstract The success of any recurrent selection program depends on the genetic variability of the evaluated population, which is used to refer to the diversity of existing alleles at many genetic loci. Thus, the goal of the present study was to investigate the impact of recurrent selection across nine cycles of a UENF-14 popcorn population through the analysis of genetic diversity and structure using microsatellite markers (EST-SSRs). Genomic DNA was extracted from young leaves of 25 individuals from each cycle (C0, C1 C2, C3, C4, C5, C6, C7, and C8), totaling 225 samples from the UENF-14 population. Fifty EST-SSR markers were used for the analysis of genetic diversity across the recurrent selection cycles, 16 of which were polymorphic. Thirty-four alleles were detected, with an average of 2.13 alleles per locus. Throughout all the recurrent selection cycles, there was a reduction in heterozygosity and an increase in inbreeding. The population structure showed a sharing of alleles, inferring that some may be directly related to the main selection characteristics
Portuguese abstract O êxito de qualquer programa de seleção recorrente depende da variabilidade genética da população avaliada, sendo utilizada para se referir à diversidade de alelos existentes nos vários locos genéticos. Assim, o objetivo do presente estudo foi investigar o impacto da seleção recorrente em nove ciclos da população UENF-14 de milho-pipoca através da análise da diversidade genética e da estrutura utilizando marcadores microssatélites (SSR-ESTs). O DNA genômico foi extraído de folhas jovens de 25 indivíduos de cada ciclo (C0, C1C2, C3, C4, C5, C6, C7 e C8) totalizando 225 amostras da população UENF-14. Para a análise da diversidade genética entre os ciclos de seleção recorrentes foram utilizados cinquenta marcadores SSR-ESTs, dos quais 16 revelaram ser polimórficos. Trinta e quatro alelos foram detectados, com uma média de 2,13 alelos por locos. Ao longo de todos os ciclos de seleção recorrentes houve uma redução na heterozigosidade e aumento na endogamia. A estrutura da população mostrou um compartilhamento de alelos inferindo que alguns podem ser direcionados para as principais características de seleção
Disciplines: Agrociencias,
Biología
Keyword: Gramíneas,
Genética,
Maíz palomero,
Zea mays,
Marcadores moleculares,
Microsatélites,
Variabilidad genética,
Heterocigosidad,
EST,
SSR
Keyword: Gramineae,
Genetics,
Popcorn,
Zea mays,
Molecular markers,
EST,
SSR,
Genetic variability,
Microsatellites,
Heterozygosity
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