| Journal: | Acta scientiarum. Agronomy |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000460158 |
| ISSN: | 1679-9275 |
| Authors: | Oñate, Felipe Alberto1 Hasbún, Rodrigo1 Mora, Freddy2 Figueroa, Carlos Rodrigo2 |
| Institutions: | 1Universidad de Concepción, Facultad de Ciencias Forestales, Concepción. Chile 2Universidad de Talca, Instituto de Ciencias Biológicas, Talca. Chile |
| Year: | 2018 |
| Volumen: | 40 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| English abstract | The Chilean strawberry [Fragaria chiloensis (L.) Mill.] is the maternal progenitor of the commercial strawberry (Fragaria ( ananassa Duch.), which is characterized by fruits with high organoleptic quality and is well-suited to areas where drought and salinity represent a constraint on crop growth and productivity. We examined the patterns of linkage disequilibrium, genetic diversity and population structure among 54 accessions of F. chiloensis to understand the genetic basis of this species. We used a core microsatellite marker set (n = 95) from a consensus linkage map of strawberry. A transferability rate of 82.1% (78/95) was found, and 38 markers were selected for this study. The SSR primers produced a total of 259 alleles, which varied between 112 and 342 bp. Lower genetic diversity at the species level (HE = 0.17, Shannon’s index = 0.28) was found compared to previous studies of this species. No climatic region pattern for SSR diversity was observed. Structure analysis suggests that the accessions are grouped into three significantly differentiated clusters. Pairwise estimates of φST indicated a low degree of differentiation between the three genetic groups (φST = 0.023 to 0.06). These groups are in concordance with potential glacial refugia in the region, with many accessions being an admixture of them |
| Portuguese abstract | O morango chileno [Fragaria chiloensis (L.) Mill.] é o progenitor materno do morangueiro comercial (Fragaria ( ananassa Duch.), caracterizado por frutos com alta qualidade organoléptica, sendo uma cultura bem adequada para áreas caracterizadas pela seca e a salinidade. Neste trabalho, foram examinados os padrões de desequilíbrio de ligação, diversidade genética e estrutura da populacional em 54 acessos de F. chiloensis, com o intuito de avaliar a base genética da espécie. Utilizou-se um conjunto de marcadores de microssatélites (n = 95) obtidos do mapa de ligação consenso do morango comercial. A taxa de transferibilidade foi de 82,1% (78/95). Dos marcadores transferidos, 38 foram selecionados e usados neste estudo, os quais produziram um total de 259 alelos, que variaram entre 112 e 342 pb. Encontrou-se uma menor diversidade genética ao nível da espécie (HE = 0,17, índice de Shannon = 0,28), em comparação com estudos prévios com a espécie. Não foi observado padrão de região climática para a diversidade genética. A análise da estrutura sugere que os acessos são agrupados em três grupos significativamente diferenciados. As estimativas de pares de φST indicaram baixo grau de diferenciação entre os três grupos genéticos (φST = 0,023 a 0,06). Esses grupos estão em concordância com os potenciais refúgios glaciários na região, sendo muitas adições uma mistura deles |
| Disciplines: | Agrociencias, Biología |
| Keyword: | Plantas para uso industrial, Genética, Diversidad genética, Fresa, Fragaria chiloensis, Chile, Microsatélites, SSR, Transferencia génica |
| Keyword: | Plants for industrial use, Genetics, Strawberry, Fragaria chiloensis, Chile, Genetic diversity, Microsatellites, SSR, Gene transfer |
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