Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers



Document title: Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers
Journal: Acta amazonica
Database: PERIÓDICA
System number: 000366224
ISSN: 0044-5967
Authors: 1
1
1
2
3
Institutions: 1Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Amazonia Oriental, Belem, Para. Brasil
2Universidade Federal do Para, Instituto de Ciencias Biologicas, Guama-Belem, Para. Brasil
3Universidade Federal Rural da Amazonia, Belem, Para. Brasil
Year:
Season: Dic
Volumen: 43
Number: 4
Pages: 461-468
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
English abstract Duplicates are common in germplasm banks and their identification is needed to facilitate germplasm bank management and to reduce maintenance costs. The aim of this work was to identify duplicates of cassava from a germplasm bank in Eastern Amazon, which had been previously characterized both morphological and agronomically. In order to be genotyped with 15 microsatellite loci, 36 accessions were selected. These accessions were classified into 13 groups of similar morpho-agronomical characteristics. All loci were polymorphic, and 75 alleles were identified, with an average of five alleles per loci and HE = 0.66. There were determined 34 pairs of genotypes with identical multiloci profiles and the probability of genetic identity was 1.1x10-12 with probability of exclusion of 99.9999%. Among these duplicates, there are accessions sampled on different years and places, but with different names and accessions with the same name sampled in different places and years. The study identified genotypes that are grown in different places and that have been maintained over the years by local farmers
Portuguese abstract Duplicatas costumam ocorrer em bancos de germoplasma e a sua identificação é necessária para facilitar o manejo dos bancos ativos de germoplasma (BAGs) e diminuir custos de manutenção. O objetivo deste trabalho foi identificar duplicatas de mandioca determinadas previamente pela caracterização morfo-agronômica, em um BAG da Amazônia Oriental. Foram selecionados 36 acessos que se agrupavam em 13 grupos de similaridade morfo-agronômica para serem genotipados com 15 locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, sendo obtidos 75 alelos, com média de cinco alelos por loco e HE = 0,66. Foram encontrados 34 pares de genótipos que apresentaram perfis multilocos idênticos e a probabilidade de identidade genética foi de 1,1x10-12 com probabilidade de exclusão de 99,9999%. Entre essas duplicatas, estão materiais coletados em épocas e locais diferentes, e com diferentes denominações e acessos com o mesmo nome coletados em diferentes locais e anos. O estudo identificou genótipos que vem sendo cultivados em diferentes locais e que vêm sendo mantidos pelos agricultores ao longo dos anos
Disciplines: Biología,
Agrociencias
Keyword: Genética,
Frutales,
Mejoramiento genético,
Germoplasma,
Marcadores moleculares,
Yuca,
Manihot esculenta
Keyword: Biology,
Agricultural sciences,
Genetics,
Fruit trees,
Plant improvement,
Germplasm,
Molecular markers,
Cassava,
Manihot esculenta
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