Characterization of lulo ( Solanum quitoense Lam.) genetic diversity in the department of Boyaca, Colombia



Título del documento: Characterization of lulo ( Solanum quitoense Lam.) genetic diversity in the department of Boyaca, Colombia
Revista: Acta agronómica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000427020
ISSN: 0120-2812
Autors: 1
1
2
Institucions: 1Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, Tunja, Boyacá. Colombia
2Universidad de Caldas, Grupo de Investigación y Proyección Producción Agropecuaria, Manizales, Caldas. Colombia
Any:
Període: Jul-Sep
Volum: 66
Número: 3
Paginació: 430-435
País: Colombia
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español El lulo (Solanum quitoense Lam.) es uno de los frutales exóticos de mayor importancia económica en la región andina, ha ganado importancia en el sector agrícola debido a sus características organolépticas y de cultivo. No existen estudios de este recurso fitogenético en la provincia de Neira, departamento de Boyacá, por lo cual el objetivo de la presente investigación fue caracterizar la diversidad genética con marcadores Microsátelites Amplificados al Azar (RAMs). Se colectaron 21 materiales de S. quitoense en los distritos de Soaquira y Sacaneca, departamento de Boyacá-Colombia, para calcular los índices de diversidad genética y similitud. El análisis mediante el coeficiente de Nei-Li permitió formar tres grupos a un nivel de similitud de 0.60, mostrando una distribución laxa de los materiales en donde no hubo correspondencia con sitio geográfico o la presencia o ausencia de espinas. Los siete cebadores RAMs generaron un total de 346 alelos que fluctuaron entre 43-48 para marcadores y marcador, respectivamente. Los valores de heterocigosidad promedio estimada variaron entre 0.33 para el cebador TG y 0.40 para CGA. El valor promedio para todos los materiales de S. quitoense evaluados fue de 0.36 más alto que lo reportado en otros estudios de diversidad genética en S. quitoense en Colombia. El valor de Fst promedio para los 21 materiales estudiados fue de 0.14, mostrando así una moderada diferenciación genética. Los marcadores RAMs permitieron identificar una alta variabilidad genética en la zona de estudio, la necesidad de niveles de subdivisión y jerarquizaciones mayores a los considerados en este estudio, lo cual permitiría un mejor aprovechamiento de la diversidad genética presente en los materiales de S. quitoense en la provincia de Neira
Resumen en inglés Lulo (Solanum quitoense Lam.) is an exotic fruit with major economic importance in the Andean region. It has gained importance in the agricultural sector due to organoleptic and cultivation characteristics. There are not studies on this plant genetic resource in the province of Neira, Boyaca department, Colombia. Given these concerns, the aim of this research was to characterize the genetic diversity with random amplified microsatellite markers (RAM). Twenty-one S. quitoense materials were collected in the Soaquira and Sacaneca, Boyaca-Colombia districts to calculate genetic diversity and similarity indices. In addition, the analysis with the Nei-Li coefficient formed three groups at 0.60 similarity level showing a loose distribution of the materials without a relationship with the geographical site or the presence or absence of thorns. The seven RAM markers generated 346 alleles, ranging between 43 and 48 for CT and TG, respectively. The average estimated heterozygosity values ​​ranged from 0.33 for TG and 0.40 for CGA. The average value for all evaluated S. quitoense materials was 0.36, higher than the reported value in other studies on S. quitoense genetic diversity in Colombia. The average Fst value for the 20 evaluated materials was 0.14, showing a moderate genetic differentiation. Overall, the RAM markers identified genetic variability in the study area, the need for levels of subdivision and hierarchization greater than those considered in this research, which would have allowed a better use of the plant genetic diversity present in S. quitoense materials in the province of Neira-Boyaca, Colombia
Disciplines Agrociencias,
Biología
Paraules clau: Frutales,
Genética,
Lulo,
Solanum quitoense,
Diversidad genética,
Microsatélites Amplificados al Azar (RAM),
Colombia
Keyword: Fruit trees,
Genetics,
Lulo,
Solanum quitoense,
Genetic diversity,
Random Amplified Microsatellites (RAM),
Colombia
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