| Revista: | Visao academica |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000443054 |
| ISSN: | 1518-5192 |
| Autores: | Gabriel, Jane Eyre1 Freitas-Lidani, Karita Claudia Farias, Rodrigo Pessoa de2 |
| Instituciones: | 1Universidade Federal do Vale do Sao Francisco, Petrolina, Pernambuco. Brasil 2Instituto do Cancer do Estado de Sao Paulo, Sao Paulo. Brasil |
| Año: | 2019 |
| Periodo: | Ene-Mar |
| Volumen: | 20 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 48-54 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en inglés | The major capsid protein L1 constitutes the entire exterior surface of the stabilized mature human papillomavirus (HPV), mediating initial attachment to host tissues or cells, and become pliable enough to ultimately allow release of the viral genome into anew target cell. The purpose of this study was to infer evolutionary relationships among different variable-risk HPV genotypes from comparative alignments of multiple sequences of the protein L1 deposited previously in biological information database. First, sequences of the proteinL1of 20HPV genotypes were searched and selected from a non-redundant protein sequence database UniProtKB/Swiss-Prot. Next, a phylogenetic dendogram was constructed by comparingmultiple sequences of the protein L1 using molecular evolutionary genetics analyses by Mega software. The dendogram generated from comparative alignments of the L1 protein sequences of different HPV types revealed the presence of two main clusters: a first cluster containing 12HPV types linked intimately in several sub-branches and a second cluster grouping 8HPV types linked in another sub-branches. Evolutionary groupings generated from L1 capsid protein sequences of variable-risk HPV genotypes demonstrated weak association between pathogenicity and phylogenetic proximity in the types analyzed, accompanied by low identity among their amino acid residues. The findings described herein reveal important insights into evolutionary patterns and phylogenetic relationships among variable-risk HPV genotypes formalignant conversion of virally infected cellsfrom multiple alignments of the major viral capsid protein L1 |
| Resumen en portugués | A proteína L1 do capsídeo maior constitui a superfície exterior do papilomavírus humano (HPV), mediando a liberação do genoma viral para uma célula-alvo hospedeira. O objetivo da presente estudo foi inferir relações evolutivas entre diferentes genótipos de HPV a partir de alinhamentos comparativos de sequências da proteína L1do capsídeo maior depositadas previamente embancosde dados de informação biológica. Sequências da proteína L1 de 20 genótipos de HPV de riscos variáveis de patogenicidade foram pesquisadas e selecionadas a partir de um banco de dados de sequências nãoredundantes de proteínas UniProtKB/Swiss-Prot. Em seguida, um dendograma filogenético foi construído pelacomparação direta das sequências da proteína L1 a partir de análises moleculares empregando o programa Mega6.0. O dendogramados alinhamentos comparativos das sequências da proteínaL1 de diferentes tipos de HPV revelou a presença de dois agrupamentosprincipais: um primeiro agrupamento com12tipos de HPV intimamente ligados em vários sub-ramos e um segundo agrupamento contendo 8tipos de HPV ligados em outrossub-ramos. Os agrupamentos evolutivos gerados a partir de sequências proteicas de capsídeo L1 de genótipos de HPV de riscos variáveisdemonstraram fraca associação entre patogenicidade e proximidade filogenética nos genótipos analisados, acompanhada de baixa identidade entre seus resíduos de aminoácidos. Os achados aqui descritos revelam importantessubsídiosacerca dospadrões evolutivos e relações filogenéticas entre genótipos de HPV de riscosvariáveispara conversão maligna de células por análises demúltiplos alinhamentos da proteína L1 docapsídeoviral |
| Disciplinas: | Medicina |
| Palabras clave: | Genotipos, Papilomavirus humano, Proteína L1, Relaciones evolutivas |
| Keyword: | Genotypes, Evolutionary relationships, Evolutive relationships, L1 protein, Human papillomavirus |
| Texto completo: | https://revistas.ufpr.br/academica/article/view/64270/38568 |
