Tecnologías ómicas para la exploración de la biocostra del suelo



Título del documento: Tecnologías ómicas para la exploración de la biocostra del suelo
Revista: Terra Latinoamericana (Edo. de Méx.)
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000454725
ISSN: 0187-5779
Autores: 1
1
Instituciones: 1Universidad Autónoma de Chihuahua, Facultad de Zootecnia y Ecología, Chihuahua. México
Año:
Periodo: Ene-Dic
Volumen: 40
País: México
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Descriptivo
Resumen en español Las tecnologías “ómicas” son herramientas novedosas que facilitan el estudio de las comunidades microbianas de distintos ecosistemas, particularmente de la costra biológica del suelo, también llamada biocostra. Entre estas tecnologías se encuentran la genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica y metagenómica, que son utilizadas para analizar la diversidad y las funciones que llevan a cabo los microorganismos a través del estudio de sus biomoléculas y vías metabólicas. Entre los microorganismos que habitan la biocostra destacan las cianobacterias, las cuales son un grupo de bacterias fototróficas encargadas de realizar procesos importantes en el suelo, tal como la fijación de nitrógeno atmosférico, carbono orgánico, síntesis de clorofila y ficobilinas, así como la producción de exopolisacáridos para mejorar la estabilidad y fertilidad del suelo. Por lo tanto, el objetivo de la presente revisión es el de explorar la diversidad y la función que desempeñan estas comunidades microbianas en la biocostra, particularmente las cianobacterias, destacando los estudios realizados mediante el uso de las tecnologías ómicas. El conocimiento generado en los últimos años a través de las tecnologías ómicas ha demostrado la limitada cobertura que presentan las técnicas moleculares tradicionales, resultando en una subestimación de la diversidad real de las comunidades microbianas. Además, se ha mejorado la comprensión de los procesos ecológicos desarrollados por los microorganismos en beneficio de la biocostra, así como las capacidades funcionales individuales y colectivas, las cuales servirán como línea base para proponer estrategias importantes que solucionen la problemática de la degradación de los suelos
Resumen en inglés Summary: The "omics" technologies are novel tools that facilitate the study of microbial communities in different ecosystems, particularly the biological soil crust, also called biocrust. These technologies include genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, and metagenomics, which are used to analyze the diversity and functions carried out by microorganisms through the study of their biomolecules and metabolic pathways. Among the microorganisms that inhabit the biocrust are the cyanobacteria, which are a group of phototrophic bacteria responsible for important processes in the soil, such as the fixation of atmospheric nitrogen, organic carbon, chlorophyll and phycobilin synthesis, as well as the production of exopolysaccharides to improve soil stability and fertility. Therefore, the objective of this review is to explore the diversity and role that these microbial communities play in the biocrust, particularly cyanobacteria, highlighting studies conducted using omics technologies. The knowledge generated in recent years through omics technologies has demonstrated the limited coverage of traditional molecular techniques, resulting in an underestimation of the real diversity of microbial communities. In addition, there has been an improvement in the understanding of the ecological processes developed by the microorganisms for the benefit of the biocrust, as well as the individual and collective functional capacities, which will serve as a baseline to propose important strategies to solve the problem of soil degradation
Disciplinas: Agrociencias
Palabras clave: Suelos,
Revisión bibliográfica,
Cianobacterias,
Fijación del nitrógeno,
Inoculación,
Restauración ecológica,
Suelos degradados
Keyword: Soils,
Bibliographic review,
Cyanobacteria,
Degraded soils,
Ecological restoration,
Inoculation,
Nitrogen fixation
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