Retinal Lesion Segmentation Using Transfer Learning with an Encoder-Decoder CNN



Título del documento: Retinal Lesion Segmentation Using Transfer Learning with an Encoder-Decoder CNN
Revista: Revista mexicana de ingeniería biomédica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000458770
ISSN: 0188-9532
Autores: 1
1
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Instituciones: 1Universidad Autónoma de Querétaro, Querétaro. México
Año:
Periodo: May-Ago
Volumen: 43
Número: 2
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español Las técnicas de Deep Learning (DL) han demostrado un buen desempeño en la detección de anomalías en imágenes de retina, pero la mayoría de los modelos son entrenados en diferentes bases de datos para resolver una tarea en específico. Como consecuencia, actualmente no se cuenta con modelos que se puedan usar para la detección/segmentación de varias lesiones o anomalías con un solo modelo. En este artículo, se utiliza Transfer Learning (TL) con la cual se aprovecha el conocimiento adquirido para determinar si una imagen de retina tiene o no una lesión. Con este conocimiento se segmenta la imagen utilizando una red neuronal convolucional (CNN), donde los encoders o extractores de características son modelos clásicos como VGG-16 y ResNet50 o variantes con módulos de atención. Se demuestra así, que es posible utilizar una metodología general con bases de datos de retina para la detección/ segmentación de lesiones en la retina alcanzando resultados como los que se muestran en el estado del arte. Este modelo puede ser entrenado con bases de datos más reales que contengan una gama de enfermedades para detectar/ segmentar sin sacrificar rendimiento. TL puede ayudar a conseguir una convergencia rápida del modelo si la base de datos principal (Clasificación) se parece a la base de datos de las tareas secundarias (Segmentación), si esto no se cumple los parámetros básicamente comienzan a ajustarse desde cero
Resumen en inglés Deep learning (DL) techniques achieve high performance in the detection of illnesses in retina images, but the majority of models are trained with different databases for solving one specific task. Consequently, there are currently no solutions that can be used for the detection/segmentation of a variety of illnesses in the retina in a single model. This research uses Transfer Learning (TL) to take advantage of previous knowledge generated during model training of illness detection to segment lesions with encoder-decoder Convolutional Neural Networks (CNN), where the encoders are classical models like VGG-16 and ResNet50 or variants with attention modules. This shows that it is possible to use a general methodology using a single fundus image database for the detection/segmentation of a variety of retinal diseases achieving state-of-the-art results. This model could be in practice more valuable since it can be trained with a more realistic database containing a broad spectrum of diseases to detect/segment illnesses without sacrificing performance. TL can help achieve fast convergence if the samples in the main task (Classification) and sub-tasks (Segmentation) are similar. If this requirement is not fulfilled, the parameters start from scratch
Disciplinas: Medicina,
Ciencias de la computación
Palabras clave: Oftalmología,
Diagnóstico,
Inteligencia artificial,
Imágenes médicas,
Transferencia de conocimiento,
Codificadores,
Retina,
Segmentación de lesiones,
Aprendizaje profundo
Keyword: Ophthalmology,
Diagnosis,
Artificial intelligence,
Medical imges,
Transfer learning,
Encoders,
Retina,
Lesion segmentation,
Deep learning
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