Revista: | Revista mexicana de biodiversidad |
Base de datos: | PERIÓDICA |
Número de sistema: | 000329373 |
ISSN: | 1870-3453 |
Autores: | González, Dolores1 |
Instituciones: | 1Instituto de Ecología, A.C., Red de Biodiversidad y Sistemática, Jalapa, Veracruz. México |
Año: | 2010 |
Periodo: | Abr |
Volumen: | 81 |
Número: | 1 |
Paginación: | 183-185 |
País: | México |
Idioma: | Español |
Tipo de documento: | Artículo |
Enfoque: | Analítico, descriptivo |
Resumen en español | Las secuencias génicas han contribuido enormemente a los estudios filogenéticos en plantas. Sin embargo, una desventaja importante en las secuencias de varios loci es su baja resolución filogenética para resolver las relaciones de taxa cercanamente relacionados. En este trabajo se propone una modificación al método SCAR que consiste en: a) digerir fragmentos polimórficos generados con marcadores RAPD en lugar de clonarlos, b) secuenciar los fragmentos digeridos y c) alinear las secuencias para diseñar oligos específicos. Esta estrategia permitió comparar de manera más rápida y sencilla regiones variables útiles para los análisis filogenéticos en rangos taxonómicos menos inclusivos |
Resumen en inglés | DNA sequence data have made a tremendous contribution to plant phylogenetics. Nonetheless, a notable shortcoming of several loci has been the poor phylogenetic resolution of relationships among closely related species. In this study a modification to the SCAR method is proposed that consists of: a) digestion of polymorphic RAPD fragments instead of cloning them, b) sequencing of the digested fragments, and c) alignment of sequences for designing specific primers. This simple approach allowed us to find variable DNA loci suitable for phylogenetic analysis at lower taxonomic ranks |
Disciplinas: | Biología |
Palabras clave: | Botánica, Evolución y filogenia, Taxonomía y sistemática, Filogenia, Marcadores moleculares, Sistemática, Taxonomía, Secuencia génica |
Keyword: | Biology, Botany, Evolution and phylogeny, Taxonomy and systematics, Phylogeny, Molecular markers, Systematics, Taxonomy, Gene sequence |
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