| Revista: | Respuestas |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000444229 |
| ISSN: | 2422-5053 |
| Autores: | Suárez Contreras, Liliana Yanet1 Yañez Meneces, Luz Francy2 |
| Instituciones: | 1Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta, Norte de Santander. Colombia 2Universidad de los Andes, Santiago de Chile. Chile |
| Año: | 2020 |
| Periodo: | Ene-Abr |
| Volumen: | 25 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 127-137 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Aplicado, descriptivo |
| Resumen en español | La identificación bacteriana se realiza por medio de métodos convencionales basados en las características bioquímicas, puesto que su realización y costos son de más fácil acceso. Sin embargo, la identificación molecular permite conocer la verdadera identidad del género y la especie. Por tal motivo se realizó la identificación molecular de 24 Cepas de bacterias conservadas en el Banco de cepas Universidad Francisco de Paula Santander, Centro Experimental Campos Elíseos, identificadas bajo criterios fenotípicos macroscópicos y microscópicos. Inicialmente se reactivaron las cepas conservadas en solución salina y se caracterizaron macro y microscópicamente, luego se realizó extracción de ADN y se procedió hacer PCR para amplificar el ARNr 16S; las muestras se enviaron a secuenciar y por medio de BLAST se conoció la identidad de cada bacteria. 11 cepas, se identificaron como Bacillus cereus; 1 cepa, como Bacillus thurigiensis; mientras que 3 cepas como Bacillus pumilus; 1 Cepa como Bacillus amyloliquefaciens; 4 cepas, conformaron el grupo de Bacillus subtilis; y es posible que existan ramificaciones divergentes entre especies de Bacillus en arboles filogenéticos. Otra agrupación que se observó en el arbol filogenético son las cepas que corresponden una a: Achromobacter xylosoxidans y otra cepa a Alcaligenes faecalis respectivamente. También otro grupo de dos cepas fueron identificadas como Stenotrophomonas maltophilia. Es importante tener en cuenta que en ocasiones el ARNr 16S presenta una baja capacidad de discriminación para algunos géneros y especies debido a recientes divergencias, es necesario complementar la identificación con el estudio de otros genes |
| Resumen en inglés | Bacterial identification is carried out by means of conventional methods based on biochemistry characteristics, since its realization and costs are easier to access. However, molecular identification allows us to know the true identity of the genus and the species. For this reason, the molecular identification of 24 strains of bacteria conserved in the Strain Bank of the Francisco de Paula Santander University, Campos Eliseos Experimental Center, was carried out, identified under macroscopic and microscopic phenotypic criteria was performed. Initially, the strains conserved in saline solution were reactivated and characterized macro and microscopically, then DNA extraction was carried out and PCR was performed to amplify the 16S rRNA; The samples were sent to be sequenced and the identity of each bacterium was known through BLAST. 11 strains were identified as Bacillus cereus; 1 strain as Bacillus thurigiensis; while 3 strains, such as Bacillus pumilus; 1 strain as Bacillus amyloliquefaciens; 4 strains, formed the group of Bacillus subtilis; and it is possible that there are divergent ramifications between Bacillusspecies in phylogenetic trees. Another group that was observed in the phylogenetic tree which correspond 1 strain to Achromobacter xylosoxidans and 1 strain to Alcaligenes faecalis respectively. Also another group of 2 strains were identified as Stenotrophomonas maltophilia. It is important to keep in mind that sometimes the 16S rRNA presents a low discrimination capacity for some genera and species due to recent divergences, it is necessary to complement the identification with the study of other genes |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Bacterias, Taxonomía y sistemática, Biología molecular, Identificación molecular, Bioinformática, Bacillus, Stenotrophomonas maltophilia, Achromobacter xylosoxidans |
| Keyword: | Bacteria, Taxonomy and systematics, Molecular biology, Molecular identification, Bioinformatics, Bacillus, Stenotrophomonas maltophilia, Achromobacter xylosoxidans |
| Texto completo: | https://revistas.ufps.edu.co/index.php/respuestas/article/view/2430/2861 |
