Huella genética de variedades de fresa obtenidas en el Colegio de Postgraduados, México



Título del documento: Huella genética de variedades de fresa obtenidas en el Colegio de Postgraduados, México
Revista: Nova scientia
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000429301
ISSN: 2007-0705
Autores: 1
2
2
2
2
2
1
2
Instituciones: 1Universidad Intercultural del Estado de Puebla, Puebla. México
2Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo, Montecillo, Estado de México. México
Año:
Periodo: May
Volumen: 11
Número: 22
Paginación: 186-206
País: México
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español En un programa de mejoramiento genético de fresa (Fragaria × ananassa) es importante contar con la metodología para evaluar la integridad genética de la planta en todas las etapas de incremento, desde diferentes criterios, como el fisiológico, morfológico y el molecular; para este propósito, una de las herramientas más apropiadas son los marcadores moleculares denominados Secuencias Simples Repetidas del inglés Simple Sequence Repeats (SSR), ya que permiten, por ejemplo, identificar poblaciones con una diversidad genética reducida, revelar genealogías, conocer el grado de parentesco entre individuos, proporcionar elementos sólidos en la defensa de la propiedad intelectual, evaluar la pureza del material vegetal, identificar el grado de variación somaclonal y evitar la mezcla de material vegetal en bancos de germoplasma. En este sentido, el presente estudio tuvo como objetivo obtener la huella genética de las variedades de fresa CP0201, CP0204, CP0615, CPLE7 desarrolladas en el Colegio de Postgraduados y como testigo la variedad Festival, desarrollada en Florida, USA, con el uso de nueve loci de microsatélites (SSR). El proceso incluyó la extracción de ADN a partir de tejido foliar de fresa, así como de la amplificación mediante PCR de punto final de los loci SSR agrupados en reacciones multiplex. Los productos de PCR fueron separados mediante electroforesis capilar y su tamaño en pares de bases se determinó con el programa GeneMapper® v. 4. A partir de las frecuencias alélicas se calcularon las matrices de distancia con los coeficientes de Jaccard y Dice. Se encontraron 63 alelos distintos, cada par de iniciadores amplificó entre 3 y 12 alelos. Los marcadores que presentaron mayor número de alelos fueron EMFn181 (11 alelos) y EMFv104 (12 alelos). Se generó la huella genética de cada variedad. Mediante los perfiles alélicos se encontraron diferencias entre las variedades CP0615, CPLE7 y Festival; CP0201 y CP0204 tuvieron una hue
Resumen en inglés In a breeding program for strawberry (Fragaria × ananassa) it is important to have a methodology to evaluate the genetic integrity of the plant in all the stages of increase, from different criteria, such as morphological, physiological and molecular; for this purpose one of the most appropriate tools are the Simple Sequence Repeats (SSR`s) molecular markers, since they allow, for example, identifying populations with a reduced genetic diversity, revealing genealogies, knowing the degree of relatedness between individuals, providing solid elements in the defense of intellectual property, evaluation of the purity of the plant material, identification of somaclonal variation and to avoid the mixture of plant material in germplasm banks. In this sense the objective of this study was to obtain the genetic fingerprint of strawberry varieties CP0201, CP0204, CP0615, CPLE7 developed at Colegio de Postgraduados and variety Festival developed at Florida, US, with the use of nine microsatellite (SSR`s) loci. The process included the DNA extraction from strawberry leaf tissue, as well as the amplification by means of PCR of the SSR`s loci grouped in multiplex reactions. The PCR products were separated by capillary electrophoresis and their size in base pairs was determined with the GeneMapper® v. 4 software. From the allele frequencies distance matrices were calculated the Jaccard and Dice coefficients. 63 different alleles were found, each pair of primers amplified between 3 and 12 alleles. The markers that presented the highest number of alleles were EMFn181 (11 alleles) and EMFv104 (12 alleles). The genetic fingerprint of each variety was generated. Differences between the CP0615, CPLE7 and Festival were found based on their allelic profiles; CP0204 and CP0201 had a similar genetic fingerprint, since they are related through their female parent; the allelic diversity index within the populations ranged from 3.96 to 5.93. The varieties had a low uniformity index
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Frutales,
Genética,
Variedades,
Fresa,
Fragaria × ananassa,
Alelos,
Marcadores moleculares,
Diversidad genética
Keyword: SSR markers,
Genetics,
Fruits,
Strawberry,
Cultivars,
Fragaria × ananassa,
SSR markers,
Alleles,
Molecular markers,
Genetic diversity
Texto completo: Texto completo (Ver HTML) Texto completo (Ver PDF)