Herramientas bioinformáticas usadas en el estudio de enzimas fenoloxidasas del género Pleurotus



Título del documento: Herramientas bioinformáticas usadas en el estudio de enzimas fenoloxidasas del género Pleurotus
Revista: Mexican journal of biotechnology
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000416840
ISSN: 2448-6590
Autores:
1
2
3
1
Instituciones: 1Universidad Autónoma de Tlaxcala, Centro de Investigación en Ciencias Biológicas, Ixtacuixtla, Tlaxcala. México
2Instituto Tecnológico Superior del Oriente del Estado de Hidalgo, Apan, Hidalgo. México
3Universidad Politécnica de Pachuca, Zempoala, Hidalgo. México
Año:
Periodo: Ene-Mar
Volumen: 3
Número: 1
Paginación: 95-118
País: México
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español El análisis bioinformático permite relacionar, predecir y analizar un conjunto de proteínas de interés que comparten áreas conservadas en co mún a través de un computador ( in silico ). E ste análisis bioinformá tico se realiza a partir de la secuencia de bases de datos, dominios y de regiones clave que conforman la función catalítica de una proteína. La secuencia de aminoácidos proporciona una p redicción correspondi ente a las regiones conservadas. Posteriormente l as secuencias de aminoácidos se acopla n de manera ordenada por su función y estructura , mismas que generan proyecciones espaciales de estructuras terciarias que permiten el reconocimient o de secuencias claves para mutaciones coordinadas. La bioinformática en las enzimas fenoloxidasa como lacasa, manganeso perox i dasa y decolorante peroxidasa permite observar estructura s proteicas, ca denas alfa y beta , así como los iones responsables de la catálisis. La s técnicas in silico juega n un papel importante en áreas como la medicina, la biotecnología y la genó mica en beneficio de la salud humana. L a técnica de secuenc iación de ADN identifica organismos por medio de secuencias de aminoác idos tomadas de bancos de datos para elaborar proteínas molde, alineamiento de secuencias, modelamientos por homología y la validación o identificación de organismos
Resumen en inglés The bioinformatic analysis allows relating, predicting and analyzing a set of proteins of interest that share conserved areas in common by using a com puter ( in silico ). This bioinformatic analysis is made from the sequence of databases, domains and key regions that make up the catalytic function of a protein. The amino acid sequence provides a prediction corresponding to the conserved regions. Subsequen tly, the amino acid sequences are coupled in an orderly manner by their function and structure, which generate spatial projections of tertiary structures that allow the recognition of key sequences for coordinated mutations. Bioinformatics in phenoloxidase enzymes such as laccase, manganese peroxidase and decolorizing peroxidase allows observing protein structures, alpha and beta chains as well as the ions responsible for catalysis. In silico techniques play an important role in different areas such as medi cine, biotechnology and genomics for the benefit of human health. The DNA sequencing technique identifies organisms by means of amino 96 Zamora - Muñoz et al. / Mexican Journal of Biotechnology 2018,3(1): 95 - 118 acid sequences taken from data base to make template proteins, sequence alignment, homology modeling and the validation or identification of organisms
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Bioquímica,
Hongos,
Proteínas,
Secuencia de aminoácidos,
Fenoloxidasa,
Bioinformática,
Pleurotus
Keyword: Biochemistry,
Fungi,
Proteins,
Aminoacid sequence,
Phenoloxidase,
Bioinformatics,
Pleurotus
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