Diagnóstico biológico e molecular e análise da seqüência de nucleotídeos do gene da proteína capsidial de um isolado do Apple stem pitting virus



Título del documento: Diagnóstico biológico e molecular e análise da seqüência de nucleotídeos do gene da proteína capsidial de um isolado do Apple stem pitting virus
Revista: Fitopatologia brasileira
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000295775
ISSN: 0100-4158
Autores: 1
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Instituciones: 1Universidade de Passo Fundo, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinaria, Passo Fundo, Rio Grande do Sul. Brasil
2Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Uva e Vinho, Bento Goncalves, Rio Grande do Sul. Brasil
3Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Recursos Geneticos e Biotecnologia, Brasilia, Distrito Federal. Brasil
Año:
Periodo: Ene-Feb
Volumen: 31
Número: 1
Paginación: 51-56
País: Brasil
Idioma: Portugués
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en inglés Apple stem pitting virus (ASPV) was detected in samples of European pear (Pyrus communis) cvs. Starkrimson and Abate Fetel, and Asian pear (P. pyrifolia var. culta) cvs. Kousui and Housui. The samples were collected in the beginning of autumn 2003 at the Experimental Station of Embrapa Uva e Vinho, Vacaria, RS. Using several combinations of primers, DNA fragments of 269 and 1554 bp were amplified, the latter containing the complete coat protein gene (1131 nt) of ASPV. Another amplified fragment of 291 bp comprised part of the viral polymerase gene. These fragments are excellent tools for the diagnosis of ASPV in pear. Comparison of the nucleotide sequences with sequences of the GenBank showed 89% identity with sequences from the German isolate of apple, and 85 to 88% with Polish isolates, both from pear. The herbaceous indicator Nicotiana occidentalis cv. 37B, mechanically inoculated with leaf extracts from cv. Housui, presented necrotic local lesions, marginal leaf necrosis and severe vein necrosis. ASPV was also detected by dot-ELISA in the cvs. Abate Fetel and Kousui, by imunoblot in the cv. Starkrimson and by indexing on Pyronia veitchii, graft-inoculated with buds of the infected cv. Abate Fetel
Resumen en portugués O Apple stem pitting virus (ASPV) foi detectado por RT-PCR em amostras de cultivares de pereiras européias (Pyrus communis L.) cvs. Starkrimson e Abate Fetel, e asiáticas (P. pyrifolia var. culta) cvs. Kousui e Housui coletadas no início do outono de 2003 em pomar da Estação Experimental da Embrapa Uva e Vinho, Vacaria, RS. Utilizando várias combinações de oligonucleotídeos, foram amplificados fragmentos de DNA de 269 e 1554 pb, este último contendo o gene completo (1131 nt) da proteína capsidial do ASPV. Outro fragmento amplificado de 291 pb compreende parte do gene da polimerase viral. Estes fragmentos constituem-se em um excelente instrumento de diagnóstico do ASPV em pereiras. A comparação das seqüências de nucleotídeos do gene da proteína capsidial do ASPV com seqüências do banco de dados GenBank, revelou identidades de 89% com seqüências de um isolado alemão de macieira e de 85 a 88% com isolados poloneses, de pereiras. A indicadora herbácea Nicotiana occidentalis cv. 37B, inoculada mecanicamente com extrato foliar da cv. Housui, apresentou lesões locais necróticas, necrose foliar marginal e das nervuras. O ASPV também foi detectado por dot-ELISA nas cvs. Abate Fetel e Kousui, na cv. Starkrimson por imunoblot, e em Pyronia veitchii (Trabut) Guill. por enxertia de borbulhas da cv. Abate Fetel infetada
Disciplinas: Agrociencias
Palabras clave: Fitopatología,
Frutales,
Virus,
Pera,
Pyrus communis,
Pyrus pyrifolia,
Malus,
Flexiviridae,
Dot-ELISA,
RT-PCR
Keyword: Agricultural sciences,
Fruit trees,
Phytopathology,
Virus,
Pear,
Pyrus communis,
Pyrus pyrifolia,
Malus,
Flexiviridae,
Dot-ELISA,
RT-PCR
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