| Revista: | Fitopatologia brasileira |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000295146 |
| ISSN: | 0100-4158 |
| Autores: | Inoue-Nagata, Alice Kazuko1 Fonseca, M. Esther N Lobo, Tatiana O.T.A Avila, Antonio C. de2 Monte, Damares C |
| Instituciones: | 1Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Recursos Geneticos e Biotecnologia, Brasilia, Distrito Federal. Brasil 2Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Hortalicas, Brasilia, Distrito Federal. Brasil |
| Año: | 2001 |
| Periodo: | Mar |
| Volumen: | 26 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 45-52 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en inglés | Two Brazilian Potato virus Y (PVY) isolates were biologically characterized as necrotic (PVY-NBR) and common (PVY-OBR) based upon symptoms on test plants. Additional characterization was performed by sequencing a cDNA corresponding to the 3' terminal region of the viral genome. The sequence consisted of 195 nucleotides (nt) coding part of the nuclear inclusion body b (NIb) gene, 804 nt of the coat protein (CP) gene, and 328 nt (PVY-OBR) or 326 nt (PVY-NBR) of the 3'-untranslated region (UTR). Translation of the sequence resulted in one single open reading frame with part of the NIb and a CP of 267 amino acids. The two isolates shared 95.1% similarity in the CP amino acid sequence. The CP and the 3'-UTR sequence of the Brazilian isolates were compared to those of other PVY isolates previously reported and unrooted phylogenetic trees were constructed. The trees revealed a separation of two distinct clusters, one comprising most of the common strains and the other comprising the necrotic strains. PVY-OBR was clustered in the common group and PVY-NBR in the necrotic one |
| Resumen en portugués | Dois isolados do vírus Y da batata (Potato virus Y, PVY) foram caracterizados biologicamente como pertencentes às estirpes necrótica (PVY-NBR ) e comum (PVY-OBR) com base nos sintomas induzidos em plantas-teste. Caracterização adicional foi realizada com a determinação da seqüência de nucleotídeos do cDNA correspondente à extremidade 3' do genoma viral. A seqüência obtida continha 195 nucleotídeos (nt) que codificam uma parte do gene da inclusão nuclear b (NIb), 804 nt da capa proteíca (CP) e 328 nt em PVY-OBR e 326 nt em PVY-NBR da região 3' não traduzida (UTR). A análise da seqüência mostrou ser composta por uma única fase aberta de leitura contendo parte do NIb e a CP consistindo de 267 aminoácidos. Os dois isolados apresentaram uma similaridade de 95,1% na seqüência de aminoácidos da CP. A CP e a seqüência 3'-UTR dos isolados brasileiros foram comparados com as seqüências de outros isolados de PVY previamente relatados e árvores filogenéticas foram construídas. As árvores mostraram a delimitação de dois grupos distintos, um contendo a maioria das estirpes comuns e o outro com as estirpes necróticas. PVY-OBR foi agrupado no grupo comum e PVY-NBR no necrótico |
| Disciplinas: | Biología, Agrociencias |
| Palabras clave: | Evolución y filogenia, Virus, Hortalizas, PVY, Virus Y de la papa, Potyvirus, Análisis filogenético, Taxonomía, Proteínas de la cápside |
| Keyword: | Biology, Agricultural sciences, Evolution and phylogeny, Virus, Vegetables, PVY, Potato virus Y, Potyvirus, Phylogenetic analysis, Taxonomy, Coat proteins |
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