DNA structure and architecture in the chromosome and plasmid of hyperthermophilic organisms, a theoretical approach



Título del documento: DNA structure and architecture in the chromosome and plasmid of hyperthermophilic organisms, a theoretical approach
Revista: Boletín de la Sociedad Geológica Mexicana
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000402025
ISSN: 1405-3322
Autores: 1
1
Instituciones: 1Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ciencias, Ciudad de México. México
Año:
Periodo: Abr
Volumen: 68
Número: 1
Paginación: 165-172
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español Los organismos hipertermofílicos han sido reconocidos tanto como un elemento importante en el origen y la evolución temprana de la vida en la Tierra, como un modelo en estudios de exobiología. Analizar sus dinámicas moleculares nos puede ayudar a entender este importante estilo de vida. En este estudio, usando scripts y software, se comparó la composición del DNA en los cromosomas y plásmidos de organismos hipertermófilos, y se analizó su estructura, su probable sesgo en el uso de aminoácidos y la flexibilidad del DNA. En algunos cromosomas y plásmidos se presentaron características diferenciales de flexibilidad del DNA y sesgos en su tasa de mutación, lo cual sugiere que sólo algunos elementos moleculares muestran altos niveles de variabilidad, contrariamente a lo propuesto en la teoría de genoma flexible
Resumen en inglés Hyperthermophilic organisms have been recognized as an important element in the origin and early evolution of life on Earth, but also as a model for exobiological studies. Analyzing their molecular dynamics can help us understand this important lifestyle. In this study, using bioinformatic tools, the DNA composition in chromosomes and plasmids of hyperthemophilic organism were compared, and their structure, probable amino acid bias and DNA flexibility were analyzed. In some chromosomes and plasmids shows differential features of DNA flexibility and skews in mutation rate, which suggests that only some molecular elements show high values of variability, contrary to the proposal of the flexible genome theory
Disciplinas: Geociencias,
Biología
Palabras clave: Geología,
Genética,
Cromosomas,
Plásmidos,
ADN,
Codones,
Hipertermófilos
Keyword: Earth sciences,
Biology,
Geology,
Genetics,
Chromosomes,
Plasmids,
DNA,
Codons,
Hyperthermophiles
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