Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon



Título del documento: Molecular characterization of progenies of bacurizeiro (Platonia insignis) from Marajó Island, northeastern Amazon
Revista: Acta amazonica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000414364
ISSN: 0044-5967
Autores: 1
2
2
2
2
3
4
Instituciones: 1Universidade Federal do Para, Instituto de Ciencias Biologicas, Belem, Para. Brasil
2Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Laboratorio de Genetica Molecular, Belem, Para. Brasil
3Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Laboratorio de Fruticultura, Belem, Para. Brasil
4Universidade Federal Rural da Amazonia, Belem, Para. Brasil
Año:
Periodo: Dic
Volumen: 47
Número: 4
Paginación: 293-300
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Nota breve o noticia
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en inglés The bacurizeiro ( Platonia insignis Mart.) is a tree native to the Amazon whose fruit is much used in the gastronomy in the North and Northeast regions of Brazil. Due to its great economic potential for these regions, the species is being conserved in germplasm banks to support genetic breeding programs. The aim of this work was the molecular characterization of P. insignis accessions belonging to the germplasm bank of the Embrapa Eastern Amazon research unit using ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) markers. Seventy-eight accessions of P. insignis belonging to 16 progenies were sampled in two different localities on Marajó Island, state of Pará, Brazil. Among the 16 progenies, seven were collected in Soure and nine in Salvaterra. The 78 accessions were genotyped with 23 pre-selected primers. We obtained 121 amplified products, of which 54 were polymorphic. The most polymorphic primers were UBC 834, UBC 899 and UBC 900. Primers UBC810 and UBC884 did not amplify polymorphic bands. Forty-nine markers out of 54 were selected for genetic analyses. AMOVA within and among progenies showed low genetic differentiation ( Φ PT = 0.064, P<0.001) with higher diversity within progenies (96%), low genetic differentiation among sampling localities ( Φ PT = 0.025, P<0.013), and higher diversity within (98%) than among localities. Clustering by UPGMA based on Jaccard similarities among pairs of accessions did not separate genotypes according to progeny or sampling localitiy. We recommend that new germplasm surveys consider a greater sampling effort within sampling localitites
Resumen en portugués O bacurizeiro ( Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR ( Inter Simple Sequence Repeat ). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética ( Φ PT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta ( Φ PT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Fitotecnia,
Botánica,
Genética,
Platonia insignis,
Mejoramiento genético,
Progenie,
Bancos de germoplasma,
Clusiaceae
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Crop husbandry,
Botany,
Genetics,
Platonia insignis,
Genetic improvement,
Progeny,
Germplasm banks,
Clusiaceae
Texto completo: Texto completo (Ver PDF)