Fast and novel botanical exploration of a 320-km transect in eastern Amazonia using DNA barcoding



Título del documento: Fast and novel botanical exploration of a 320-km transect in eastern Amazonia using DNA barcoding
Revista: Acta Amazonica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000446713
ISSN: 0044-5967
Autores: 1
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Instituciones: 1Royal Botanic Gardens, Kew, Kew, Richmond. Reino Unido
2Universite de Guyane, Centre National de la Recherche Scientifique, Cayena, Guayana Francesa. Francia
3Universite de Montpellier I, Institut de Recherche pour le Developpment, Montpellier, Herault. Francia
4University of Arizona, International Research Laboratory Interdisciplinary Global and Environmental Studies, Tucson, Arizona. Estados Unidos de América
5Universite Paul Sabatier, Centre National de la Recherche Scientifique, Toulouse, Haute-Garonne. Francia
Año:
Periodo: Ene-Mar
Volumen: 52
Número: 1
Paginación: 29-37
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en inglés We explored a 320-km transect in the Tumucumaque mountain range along the border between southern French Guiana and Brazil, sampling all trees and lianas with DBH ≥ 10 cm in seven 25 x 25-m plots installed near seven boundary milestones. We isolated DNA from cambium tissue and sequenced two DNA barcodes (rbcLa and matK) to aid in species identification. We also collected fertile herbarium specimens from other species (trees/shrubs/herbs) inside and outside the plots. The selected DNA barcodes were useful at the family level but failed to identify specimens at the species level. Based on DNA barcoding identification, the most abundant families in the plots were Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae and Sapotaceae. One third of the images of sampled plants posted on the iNaturalist website were identified by the community to species level. New approaches, including the sequencing of the ITS region and fast evolving DNA plastid regions, remain to be tested for their utility in the identification of specimens at lower taxonomic levels in floristic inventories in the Amazon region
Resumen en portugués Um transecto de 320 km foi explorado na Serra do Tumucumaque, ao longo da fronteira entre o sul da Guiana Francesa e o Brasil por meio da amostragem de todas as árvores e lianas com DAP ≥ 10 cm em sete parcelas de 25 x 25 m instaladas perto de sete marcos fronteiriços. Isolamos DNA de tecido cambial e sequenciamos dois códigos de barra de DNA (rbcLa e matK) para auxiliar na identificação das espécies. Também coletamos espécimes de herbário férteis de outras espécies (árvores/arbustos/ervas) dentro e fora das parcelas. Os códigos de barra de DNA selecionados foram úteis em nível de família, mas não conseguiram identificar espécimes em nível de espécie. Com base na identificação de DNA barcoding, as famílias mais abundantes nas parcelas foram Burseraceae, Fabaceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae e Sapotaceae. Um terço das imagens de plantas amostradas postadas no website iNaturalist foram identificadas em nível de espécie. Novas abordagens, incluindo o sequenciamento da região ITS e regiões de DNA plastidial de rápida evolução, ainda precisam ser testadas quanto à sua utilidade na identificação de espécimes até níveis taxonômicos mais baixos em inventários florísticos na região amazônica
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Botánica,
Taxonomía y sistemática,
Exploraciones botánicas,
ADN,
Código de barras,
Inventario forestal,
Amazonas
Keyword: Botany,
Taxonomy and systematics,
DNA,
Barcodes,
Forest inventory,
Amazon
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