Estudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea mays L.) criollo e indígena Colombiano, utilizando una región de ADN cloroplástico



Título del documento: Estudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea mays L.) criollo e indígena Colombiano, utilizando una región de ADN cloroplástico
Revista: Acta agronómica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000427199
ISSN: 0120-2812
Autores: 1
1
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Instituciones: 1Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Palmira, Valle del Cauca. Colombia
Año:
Periodo: Ene-Jun
Volumen: 64
Número: 1
Paginación: 72-82
País: Colombia
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español Se exploró en forma preliminar la diversidad genética existente en las 23 razas de maíz criollo e indígena descritas para Colombia por Roberts y colaboradores (1957), para el efecto se evaluaron 28 cebadores nucleares y cloroplásticos. Catorce de ellos amplificaron en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y fueron enviados para secuenciar a Macrogen Inc. (Corea). Mediante programas bioinformáticos (BioEdit 7.1.0, ClustalW versión 1.81, EditPlus Text Editor versión 3.20 y Gblock 0.91b 8) se encontró que ocho de estos cebadores presentaron un nivel alto de polimorfismo. La región genómica cloroplástica AtpB-1–RbcL-1 mostró el mayor polimorfismo y por tanto se utilizó para evaluar 23 materiales representativos de las 23 razas conservadas en el Banco de Germoplasma del CIMMYT (Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo) en México. Con el análisis de secuencias se revalidaron y confrontaron los grupos raciales obtenidos en el presente estudio ─tres razas primitivas, siete razas probablemente introducidas, y 13 razas híbridas colombianas─ con aquellos establecidos por Roberts y colaboradores, en los cuales se encontraron dos razas primitivas, nueve probablemente introducidas y 12 híbridas colombianas y con los grupos establecidos por Cardona (2010) utilizando la metodología Ward-MLM para los mismos caracteres descritos por Roberts et al. (1957), donde se encontraron cinco razas primitivas, siete probablemente introducidas y nueve híbridas colombianas. Con base en lo anterior, en el presente trabajo se hizo un aporte metodológico para revalidar datos históricos y redefinir grupos raciales
Resumen en inglés In order to preliminarily explore the genetic diversity in the 23 Colombian races of maize described by Roberts and co-workers (1957), this study evaluate 28 nuclear and chloroplast primers. Of these, 14 amplified in the PCR, which were sent to sequencing to Macrogen Inc. (Korea). Bioinformatics programs revealed that six of these primers had a high level of polymorphism. It was considered that the genomic chloroplast region atpB-rbcL-1-1 showed the highest polymorphism, therefore was used to evaluate 23 materials, representative of the 23 races, stored in the CIMMYT germplasm bank, Mexico. By analyzing sequences we could defend and confront racial groups obtained in the present study (‘primitive races’ three, ‘probably introduced’ seven, ‘Colombian hybrid’, 13) with those established by Roberts and co-workers at 50, shown two ‘primitive’, nine ‘probably introduced’ and twelve ‘Colombian hybrid’ and the groups set by Cardona (2010), applying the strategy Ward-MLM for the same characters described by Roberts et al. (1957), which shows five ‘primitive’, seven ‘probably introduced’ and nine ‘Colombian hybrid’ races. Thus, it makes a methodological contribution to validate historical data and redefine racial groups
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Gramíneas,
Genética,
Maíz criollo,
Zea mays,
Diversidad genética,
Razas,
ADN,
Cloroplastos,
Colombia
Keyword: Gramineae,
Genetics,
Native maize,
Zea mays,
Genetic diversity,
Races,
Chloroplasts,
DNA,
Colombia
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