| Revista: | Acta agronómica |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000427263 |
| ISSN: | 0120-2812 |
| Autores: | Martínez Pacheco, Leonardo1 Vanegas Berrouet, Katherin2 Salazar Yepes, Mauricio2 Gutiérrez Sánchez, Pablo1 Marín Montoya, Mauricio1 |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Medellín, Antioquia. Colombia 2Universidad Nacional de Colombia, Museo Micológico, Medellín, Antioquia. Colombia |
| Año: | 2014 |
| Periodo: | Oct-Dic |
| Volumen: | 63 |
| Número: | 4 |
| Paginación: | 377-387 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en español | Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sensibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos foliares, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indicaron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1, fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos microbiológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con MseI (=Tru1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii. Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol |
| Resumen en inglés | Colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose in common bean, is one of the most important pathogens of this crop around the world. Accurate detection and identification of this fungus is of paramount importance for adequate management of this disease; in this respect, molecular tests are the fastest and most sensitive methods. In this work, the usefulness of four primer sets (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 and ClF432/ClR533) for PCR detection and identification of C. lindemuthianum was evaluated using leaf, pod and seed tissues of common bean crops from Antioquia, Colombia. The results suggest that primers CD1/CD2, targeting iron permease pseudogen Ftr1, were the most effective in detecting DNA from both microbiological isolates and infected bean tissues, including seeds. In the case of primers CY1/CY2 targeting the rDNA ITS region, a PCR-RFLP strategy is recommended using MseI (=Tru1I) to differentiate C. lindemuthianum from C. orbiculare and C. trifolii. These primers produced better results when combined with universal primers ITS1 (ITS1/CY2) and ITS4 (CY1/ITS4). Primers ClF4/ ITS4 were non-specific while ClF432/ClR533 result in bands with poor resolution in agarose gels. This study will serve as support of seed certification and genetic improvement programs in common bean |
| Disciplinas: | Agrociencias, Biología |
| Palabras clave: | Leguminosas, Fitopatología, Biología celular, Hongos, Frijol, Phaseolus vulgaris, ADN ribosomal, Antracnosis, Permeasas, Fierro, Colletotrichum lindemuthianum, RFLP-PCR, Colombia |
| Keyword: | Legumes, Phytopathology, Cell biology, Fungi, Bean, Phaseolus vulgaris, Ribosomal DNA, Anthracnose, Iron, Permeases, Colletotrichum lindemuthianum, RFLP-PCR, Colombia |
| Texto completo: | Texto completo (Ver PDF) |
