Physiological diversity and characterization of benthic microaerobic bacteria



Título del documento: Physiological diversity and characterization of benthic microaerobic bacteria
Revista: Terra latinoamericana (Edo. de Méx.)
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000393191
ISSN: 1870-9982
Autores: 1
2
1
3
1
4
1
Instituciones: 1Universidad Autónoma Metropolitana, Departamento El Hombre y su Ambiente, Xochimilco, Distrito Federal. México
2PROBIODEM, S.A. de C.V., Tenancingo, Estado de México. México
3Universidad Autónoma Metropolitana, Departamento de Producción Agrícola y Animal, Xochimilco, Distrito Federal. México
4Aix-Marseille University, Marseille, Bouches-du-Rhone. Francia
Año:
Periodo: Ene-Mar
Volumen: 33
Número: 1
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español Los ésteres metílicos de los ácidos grasos (FAME) de las membranas celulares de procariontes se han estudiado poco en comunidades bacterianas de vida libre que habitan en los sedimentos de ecosistemas acuáticos. La escasez de información es mayor cuando se trata de la comunidad bacteriana microaeróbica que habita en las zonas subóxicas de los sedimentos y de cuerpos de agua estratificados. Por lo anterior en el presente trabajo se reporta la diversidad de los FAME, molecular y fisiológica de 15 cepas bacterianas microaeróbicas bentónicas aisladas de tres ecosistemas acuáticos mexicanos. Se realizó un análisis del perfil FAME, una amplificación del segmento 16S rDNA y un fisiológico a diferentes pO2. Dos cepas presentaron un metabolismo microaeróbico estricto y las otras 13 microaeróbico facultativo. Las especies identificadas fueron Caulobacter sp., Ochrobactrum anthropi, Sphingobium sp., Bacillus firmus, Bacillus sp., Pseudomonas stutzeri, y Sphingomonas sp. Cuatro ácidos grasos fueron característicos de las cepas de sedimentos lagunares (C20:4n6, C22:6n3 and C23:0) y tres de marinos (C22:0, C22:1n9 and C24:0). Algunos fueron característicos de un género o especie: el C22:6n3 de Ochrobactrum anthropi , el C6:0 de Caulobacter sp. y el C22:0 de Sphingobium sp. y Sphingobium amiense
Resumen en inglés Fatty acid methyl esters (FAME) of prokaryote cell membranes have been scarcely studied in free-living bacterial communities from aquatic ecosystem sediments. There is even less information on the microaerobic bacterial communities from suboxic areas of sediments or stratified water bodies. This paper reports the phenotypical and molecular diversity of FAME of 15 benthic microaerobic bacterial strains isolated from three Mexican aquatic ecosystems. A FAME profile analysis, amplification of segment 16S rDNA and physiological assays at different pO2 were performed. Two of the strains exhibited strict microaerobic metabolism and the other 13 had facultative microaerobic metabolism. The species identified were Caulobacter sp., Ochrobactrum anthropi, Sphingobium sp., Bacillus firmus, Bacillus sp., Pseudomonas stutzeri and Sphingomonas sp. Four fatty acids were characteristic of lagoon sediment strains (C20:4n6, C22:6n3 and C23:0) while three were of marine origin (C22:0, C22:1n9 and C24:0). Some are characteristic of one genus or species: C22:6n3 for Ochrobactrum anthropic ; C6:0 for Caulobacter sp.; and C22:0 for Sphingobium sp. and Sphingobium amiense
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Bacterias,
Biología acuática,
Bacterias microaerófilas,
Fisiología,
Ecosistemas acuáticos,
Bentos,
Esteres metílicos,
Acidos grasos,
ADN ribosomal,
Fenotipos,
Sedimentos
Keyword: Biology,
Aquatic biology,
Bacteria,
Microaerophilic bacteria,
Physiology,
Aquatic ecosystems,
Benthos,
Methyl esters,
Fatty acids,
Ribosomal DNA,
Phenotypes,
Sediments
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