Revista: | Tecnociencia Chihuahua |
Base de datos: | PERIÓDICA |
Número de sistema: | 000450081 |
ISSN: | 1870-6606 |
Autores: | Maldonado Moreno, Karen1 Martell Gaytán, Rocío1 Alvarado Tenorio, Bonifacio1 Valero Galván, José1 Martínez Martínez, Alejandro1 Díaz Sánchez, Angel Gabriel1 González Fernández, Raquel1 |
Instituciones: | 1Universidad Autónoma de Ciudad Juárez, Instituto de Ciencias Biomédicas, Ciudad Juárez, Chihuahua. México |
Año: | 2017 |
Periodo: | Sep-Dic |
Volumen: | 11 |
Número: | 3 |
Paginación: | 127-137 |
País: | México |
Idioma: | Español |
Tipo de documento: | Artículo |
Enfoque: | Experimental, aplicado |
Resumen en español | En este trabajo se compararon tres técnicas de extraccion de proteínas actualmente empleadas en proteómica, para determinar la mas eficiente para realizar electroforesis bidimensional (2-DE) en tejido cerebral y linfocitos de sangre periferica de rata. Los metodos utilizados fueron el uso directo de solucion de lisis, el metodo TCA/acetona-DTT y el metodo TCA/acetona-fenol. Una vez que se realizo la extraccion, se separaron las proteinas por medio de electroforesis en geles de poliacrilamida en condiciones desnaturalizantes (SDS-PAGE) y 2-DE, con el objetivo de seleccionar cual de ellos brindo un mayor rendimiento en la cantidad de proteinas totales, asi como en el numero de bandas bien definidas y manchas bien enfocadas en los geles 2-DE, tanto para cerebro como para linfocitos. Al comparar el perfil proteico, en cerebro se detectaron 13 ± 0; 15 ± 1 y 12 ± 1 bandas bien definidas mediante los metodos de TCA/ acetona-DTT, TCA/acetona-fenol y solucion de lisis, respectivamente. En linfocitos, se encontraron 19 ± 1.20 ± 0 y 19 ± 1 bandas, respectivamente. Con respecto al proteoma, tanto en cerebro como en linfocitos se encontro mayor numero de manchas proteicas consistentes y bien enfocadas con el metodo de TCA/acetona-DTT. Estos resultados mostraron que el mejor metodo de extraccion de proteinas para su uso en la 2-DE correspondio al de TCA/acetona-DTT, siendo ademas mas rapido y sencillo de realizar que el metodo de TCA/acetona-fenol |
Resumen en inglés | In this work, protein extraction techniques currently used inproteomics were compared to determine the most efficient to carryout two-dimensional electrophoresis (2-DE) on brain tissue andperipheral lymphocytes of rat. The methods used were using lysissolution, TCA/acetone-DTT method, and TCA/acetone-phenol method.Once the extraction was performed, proteins were separated byelectrophoresis in polyacrylamide gels under denaturing conditions(SDS-PAGE) and 2-DE, with the aim of detecting which of them gave agreater performance in quantity of total proteins as well as the numberof well-defined bands and well-focused spots on 2-DE gels both brain aslymphocytes. When comparing the protein profile in brain, 13 ± 0;15 ± 1, and 12 ± 1 bands was detected well-defined in the TCA/acetone-DTT, TCA/acetone-phenol lysis solution methods, respectively. Inlymphocytes, 19 ± 1, 20 ± 0, and 19 ± 1 bands were found, respectively.Regarding proteome, both in brain and lymphocytes, a greater numberof consistent and well-focused protein spots were found by TCA/acetone-DTT method. These results showed that the best method ofprotein extraction to use in 2-DE corresponded to the TCA/acetone-DTT, being faster and easier to perform than the method of TCA/acetone-phenol |
Disciplinas: | Biología, Química |
Palabras clave: | Bioquímica, Proteómica, Extracción de proteínas, Métodos de extracción, Linfocitos, Cerebro, Electroforesis bidimensional |
Keyword: | Biochemistry, Proteomics, Protein extraction, Extraction methods, Lymphocytes, Brain, Bidimensional electrophoresis |
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