Molecular epidemiology of avian rotavirus in fecal samples of broiler chickens in Amazon Region, Brazil, from August 2008 to May 2011



Título del documento: Molecular epidemiology of avian rotavirus in fecal samples of broiler chickens in Amazon Region, Brazil, from August 2008 to May 2011
Revista: Revista Pan-Amazonica de saude
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000378532
ISSN: 2176-6223
Autores: 1
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4
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6
2
Instituciones: 1Ministerio da Agricultura, Pecuaria e Abastecimento, Laboratorio Nacional Agropecuario, Belem, Para. Brasil
2Instituto Evandro Chagas, Secao de Virologia, Ananindeua, Para. Brasil
3Universidade Federal Rural da Amazonia, Instituto de Saude e Producao Animal, Belem, Para. Brasil
4Instituto Evandro Chagas, Secao de Meio Ambiente, Ananindeua, Para. Brasil
5Universidade Federal do Para, Instituto de Ciencias Biologicas, Belem, Para. Brasil
6Universidade Estadual de Londrina, Departamento de Medicina Veterinaria Preventiva, Londrina, Parana. Brasil
Año:
Volumen: 4
Número: 2
Paginación: 55-62
País: Brasil
Idioma: Portugués
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español Las virosis entéricas causan enfermedades en aves que resultan en pérdidas económicas. El rotavirus aviario (AvRV) es el virus más importante asociado a la enteritis en aves domésticas. Los principales objetivos de este estudio fueron de determinar la prevalencia del AvRV usando pruebas moleculares en pollos de corte (Gallus gallus) de la mesorregión metropolitana de Belém (Estado de Pará, Brasil), de suministrar informaciones epidemiológicas y comparar los rotavirus detectados con las cepas a través del análisis filogenético. Fueron recolectadas muestras fecales en 37 pollerías y fueron hechas pruebas para el gen NSP4 usando la reacción en cadena de la polimerasa por transcriptasa reversa (RT-PCR). En total, de las 85 muestras fecales, 35 (41,2%) son positivas para NSP4. Se encontraron 19 (51,4%) pollerías con al menos una jaula positiva para AvRV. Considerando la distribución de muestras positivas por edad, los pollos de 31-45 días contenían 18 (51,4%) de las 35 muestras positivas para rotavirus. Analizando los datos por la densidad poblacional, las jaulas con más de 9 aves/m2 tuvieron 25 (86,2%) muestras positivas, demostrando que mayores índices de infección se hallaron en jaulas con mayor densidad. Para confirmar los resultados de la RT-PCR y realizar el análisis filogenético, se seleccionaron 20 muestras positivas por secuencia. Los rotavirus detectados en nuestro estudio fueron reunidos en un único grupo y tuvieron 93,5 a 100% de identidad secuencial a nivel de nucleótidos. El grupo de edad más afectado incluyó pollos de corte con más de 15 días. Las condiciones climáticas y la elevada densidad poblacional favorecieron la diseminación del AvRV y su manutención uniforme entre las estaciones
Resumen en inglés Enteric viruses cause avian diseases that result in economic losses. Avian Rotavirus (AvRV) is the most important virus associated with enteritis in poultry. The main goals of this study were to determine the prevalence of AvRV using molecular tests in broiler chickens (Gallus gallus) from the metropolitan mesoregion of Belém (Pará State, Brazil), to provide epidemiological information, and to compare the rotaviruses detected in this study with reference to strains by phylogenetic analysis. Pooled fecal samples were collected from 37 poultry farms. The samples were tested for the NSP4 gene using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). In total, 35 (41.2%) of the 85 fecal samples were positive for NSP4. There were 19 (51.4%) farms with at least one poultry house positive for AvRV. Considering the distribution of positive samples by age, the chicks aged 31-45 days comprised 18 (51.4%) of the 35 rotavirus-positive samples. Analyzing the data by density population, the houses with more than 9 birds/m2 had 25 (86.2%) positive samples, showing that higher infection rates occurred in higher density houses. To confirm the RT-PCR results and perform phylogenetic analysis, 20 positive samples were selected for sequencing. The rotaviruses detected in our study were clustered in a single group and had 93.5 to 100% sequence identity at the nucleotide level. The most affected age group included broiler chickens older than 15 days. Climatic conditions and high population densities favored the spread of AvRV and supported its uniform maintenance between seasons
Resumen en portugués As viroses entéricas causam doenças em aves que resultam em perdas econômicas. O rotavírus aviário (AvRV) é o vírus mais importante associado à enterite em aves domésticas. Os principais objetivos deste estudo foram determinar a prevalência do AvRV, usando testes moleculares em frangos de corte (Gallus gallus) da mesorregião metropolitana de Belém (Estado do Pará, Brasil), fornecer informações epidemiológicas e comparar os rotavírus detectados com as cepas através da análise filogenética. Amostras fecais foram coletadas em 37 aviários e foram testadas para o gene NSP4 usando a reação em cadeia da polimerase via transcrição reversa (RT-PCR). No total, das 85 amostras fecais, 35 (41,2%) mostram-se positivas para NSP4. Foram encontrados 19 (51,4%) aviários com pelo menos um galpão positivo para AvRV. Considerando a distribuição de amostras positivas por idade, os frangos de 31-45 dias continham 18 (51,4%) das 35 amostras positivas para rotavírus. Analisando os dados pela densidade populacional, os galpões com mais de 9 aves/m2 tiveram 25 (86,2%) amostras positivas, mostrando que índices maiores de infecção ocorreram em galpões de maior densidade. Para confirmar os resultado da RT-PCR e realizar a análise filogenética, 20 amostras positivas foram selecionadas por sequência. Os rotavírus detectados em nosso estudo foram reunidos em um único grupo e tiveram 93,5 a 100% de identidade sequencial no nível de nucleotídeos. O grupo etário mais atingido incluiu frangos de corte com mais de 15 dias. As condições climáticas e a alta densidade populacional favoreceram a disseminação do AvRV e sua manutenção uniforme entre as estações
Disciplinas: Medicina veterinaria y zootecnia
Palabras clave: Medicina veterinaria,
Aves,
Virosis,
Rotavirus,
Epidemiología molecular,
Pollos
Keyword: Veterinary medicine and animal husbandry,
Poultry,
Veterinary medicine,
Virosis,
Rotavirus,
Molecular epidemiology,
Broilers,
Birds
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