| Revista: | Revista de matemática: Teoría y aplicaciones |
| Base de datos: | |
| Número de sistema: | 000603221 |
| ISSN: | 1409-2433 |
| Autores: | Alvarez González, Ernesto1 |
| Instituciones: | 1Universidad Complutense de Madrid, Departamento de Geometría, Algebra y Topología, Madrid. España |
| Año: | 2023 |
| Volumen: | 30 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 69-85 |
| País: | Costa Rica |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Resumen en inglés | We aim to fit 4-state sequences of DNA characters from three species to a tripod tree, whose evolutionary model is Jukes-Cantor. For this purpose, we adapt the closest tree method used in the fit of 2-state sequences coming from four species to a quartet, where the states are purines and pyrimidines and the evolutionary model is CFN. The adaptation requires a multi stage methodology called reduction process. We take the frequencies of 2-state character patterns on the quartet as parameters and search for solutions to the fit. |
| Resumen en español | Nuestro objetivo es adaptar secuencias de caracteres de ADN con cuatro estados provenientes de tres especies a un árbol filogenético tipo trípode, cuyo modelo evolutivo es Jukes-Cantor. Para ello, adaptamos el método del árbol más cercano utilizado en el ajuste de secuencias de 2 estados provenientes de cuatro especies a un cuarteto, donde los estados son purinas y pirimidinas y el modelo evolutivo es CFN. La adaptación requiere una metodología de múltiples etapas llamada proceso de reducción. Tomamos las frecuencias de los patrones de caracteres de 2 estados en el cuarteto como parámetros y buscamos soluciones para el ajuste. |
| Disciplinas: | Matemáticas |
| Palabras clave: | Matemáticas aplicadas |
| Keyword: | Applied mathematics |
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