HyRPNI Algorithm and an Application to Bioinformatics



Título del documento: HyRPNI Algorithm and an Application to Bioinformatics
Revista: Revista de ingeniería. Universidad de los Andes
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000349390
ISSN: 0121-4993
Autores: 1
1
2
3
Instituciones: 1Pontificia Universidad Javeriana, Cali, Valle del Cauca. Colombia
2Universidad del Valle, Cali, Valle del Cauca. Colombia
3Universidad Politécnica de Valencia, Departamento de Sistemas Informáticos y Computación, Valencia. España
Año:
Periodo: Ene-Jun
Número: 33
Paginación: 44-52
País: Colombia
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado, descriptivo
Resumen en español Proponemos un algoritmo de inferencia gramatical para lenguajes regulares que permite ahorrar cómputo al usar dos criterios diferentes para elegir los estados a ser procesados, un criterio se usa en la primera fase del proceso de inferencia (al principio) y el otro en el resto del proceso. Realizamos experimentos para observar el desempeño del algoritmo, para aprender sobre el tamaño ideal de su primera fase y para mostrar en bioinformática: la predicción de sitios de corte Potyviridae
Resumen en inglés We propose a grammar inference algorithm for regular languages which saves computational cost by using two different criteria to choose states to be processed: beginning and another for the rest of the process. We applied experiments to observe performance of the problem in Bioinformatics: the cleavage site prediction problem in polyproteins encoded by viruses of the Potyviridae family
Disciplinas: Ciencias de la computación,
Biología
Palabras clave: Genética,
Bioinformática,
Algoritmos,
Lenguajes formales,
Aprendizaje de máquinas,
Codificación genética,
Potyvirus
Keyword: Computer science,
Biology,
Genetics,
Bioinformatics,
Algorithms,
Formal languages,
Genetic coding,
Machine learning,
Potyvirus
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