Genetic diversity in sugar apple (Annona squamosa L.) by using RAPD markers



Título del documento: Genetic diversity in sugar apple (Annona squamosa L.) by using RAPD markers
Revista: Revista Ceres
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000363721
ISSN: 0034-737X
Autores: 1
2
2
2
2
4
Instituciones: 1Universidade Federal Rural de Pernambuco, Departamento de Agronomia, Recife, Pernambuco. Brasil
2Universidade Estadual de Montes Claros, Departamento de Ciencias Agrarias, Janauba, Minas Gerais. Brasil
3University of Florida, Tropical Research and Education Center, Homestead, Florida. Estados Unidos de América
Año:
Periodo: May-Jun
Volumen: 60
Número: 3
Paginación: 428-428
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en inglés Genetic diversity in a collection of 64 sugar apple accessions collected from different municipalities in northern Minas Gerais was assessed by RAPD analysis. Using 20 selected RAPD primers 167 fragments were generated, of which 48 were polymorphic (28.7%) producing an average of 2.4 polymorphic fragments per primer. Low percentage of polymorphism (< 29%) was observed by using the set of primers indicating low level of genetic variation among the 64 accessions evaluated. Genetic relationships were estimated using Jaccard's coefficient of similarity. Accessions from different municipalities clustered together indicating no correlation between molecular grouping and geographical origin. The dendrogram revealed five clusters. The first cluster grouped C19 and G29 accessions collected from the municipalities of Verdelândia and Monte Azul, respectively. The second cluster grouped G16 and B11 accessions collected from the municipalities of Monte Azul and Coração de Jesus, respectively. The remaining accessions were grouped in three clusters, with 8, 15 and 37 accessions, respectively. In summary, RAPD showed a low percentage of polymorphism in the germplasm collection
Resumen en portugués A diversidade genética da coleção de 64 acessos de pinheira, coletados em diferentes cidades, no norte do Estado de Minas Gerais, foi avaliada por meio do uso de marcadores RAPD. Foram selecionados 20 primers RAPD que geraram 167 fragmentos, dos quais 48 foram polimórficos (28,7%), produzindo uma média de 2,4 fragmentos polimórficos por primer. Baixa percentagem de polimorfismo foi obtida com o conjunto de primers (< 29%), indicando baixa variação genética entre os 64 acessos avaliados. As distâncias genéticas foram estimadas, utilizando-se o coeficiente de similaridade de Jaccard. Acessos de diferentes cidades foram agrupados em um mesmo grupo, indicando que não há correlação entre os agrupamentos moleculares e origem geográfica. O dendrograma revelou cinco grupos. O primeiro grupo reuniu os acessos C19 e G29, coletados nas cidades de Verdelândia e Monte Azul, respectivamente. O segundo grupo reuniu os acessos G16 e B11, coletados nas cidades de Monte Azul e Coração de Jesus, respectivamente. Os acessos remanescentes foram agrupados em três grupos, com oito, 15 e 37 acessos, respectivamente. O marcador RAPD apresentou baixo nível de polimorfismo entre os acessos avaliados
Disciplinas: Agrociencias,
Química
Palabras clave: Frutales,
Bioquímica,
Genética,
Adhesions,
Marcadores moleculares,
Variabilidad,
Germoplasma
Keyword: Agricultural sciences,
Chemistry,
Fruit trees,
Biochemistry,
Genetics,
Accessions,
Molecular markers,
Variability,
Germplasm
Texto completo: Texto completo (Ver PDF)