Phylogenetic tree calculations using the Grid with DAG workflow job



Título del documento: Phylogenetic tree calculations using the Grid with DAG workflow job
Revista: RET. Revista de estudios transdisciplinarios
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000357028
ISSN: 1856-9161
Autores: 1
2
3
3
Instituciones: 1Instituto de Estudios Avanzados, Caracas, Distrito Federal. Venezuela
2Parque Tecnológico Mérida, Masini, Mérida. Venezuela
3Centro de Investigaciones Energéticas, Medioambientales y Tecnológicas, Madrid. España
Año:
Periodo: Jul-Dic
Volumen: 1
Número: 2
Paginación: 25-30
País: Venezuela
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en inglés The goal of the work is to implement molecular phylogenetic calculations using the Grid paradigm by means of the MrBayes software using Directed Acyclic Graphs (DAG) jobs. In this method, a set of jobs depends on the input or the output of other jobs. Once the runs have been successfully done, all the results can be collected by a specific Perl script inside the defined DAG job. For testing this methodology, we calculate the evolution of papillomavirus with 121 sequences
Disciplinas: Biología,
Ciencias de la computación
Palabras clave: Procesamiento de datos,
Filogenia,
Filogenia molecular,
Gráficas
Keyword: Biology,
Computer science,
Data processing,
Phylogeny,
Molecular phylogeny,
Graphs
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