Modelamiento de Glicosil hidrolasas de la familia Ustilaginaceae empleando el servidor en línea SWISS-MODEL



Título del documento: Modelamiento de Glicosil hidrolasas de la familia Ustilaginaceae empleando el servidor en línea SWISS-MODEL
Revista: Mexican journal of biotechnology
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000416838
ISSN: 2448-6590
Autores: 1
1
2
1
Instituciones: 1Universidad Autónoma de Tlaxcala, Centro de Investigación en Ciencias Biológicas, Ixtacuixtla, Tlaxcala. México
2Colegio de Postgraduados, Campus Puebla, Puebla. México
Año:
Periodo: Ene-Mar
Volumen: 3
Número: 1
Paginación: 73-81
País: México
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español En este trabajo se realizó la búsqueda de 20 secuencias proteicas de la familia Ustilaginaceae en la base de datos de NCBI para su posterior modelamiento . El modelamiento de estas proteínas utilizando el servidor en línea SWISS - MODEL permitió apreciar las regiones conservadas en 17 proteínas a través de la presencia de estructuras secundarias como α - hélices y hojas - β , sin embargo tres de ellas no presentaron similitud estructural con el resto de las proteínas. Se sugiere realizar estudio s sobre la comp osición de los aminoácidos del sitio act ivo y sobre la región del péptido señal, así como llevar a cabo un análisis filogenético de las proteínas con mayor similitud
Resumen en inglés In this work, 20 protein sequences of the Ustilaginaceae family were searched for modeling in the NCBI database . The modeling of these proteins using the online SWIS S - MODEL server allowed appreciating the regions conserved in 17 proteins through the presence of secondary structures such as α - helices and β - sheets, however, three of them did not show structural similarity with the rest of proteins. Further studies need to be undertaken on the composition of the amino ac ids of the active site and on the signal peptide region , as well as carrying out a protein phylogenetic analysis with greater similarity
Disciplinas: Biología,
Química
Palabras clave: Hongos,
Bioquímica,
Glucosil hidrolasa,
Secuencia proteica,
Modelación química,
Ustilaginaceae
Keyword: Fungi,
Biochemistry,
Glycosyl hydrolase,
Protein sequence,
Chemical modelling,
Ustilaginaceae
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