| Revista: | Madera y bosques |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000453513 |
| ISSN: | 1405-0471 |
| Autores: | Sandoval Padilla, Isaac1 Contreras Toledo, Aremi Rebeca1 Guzmán, Luis Felipe1 Amaro González, Blanca Amalia1 Cortés Cruz, Moisés1 |
| Instituciones: | 1Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Centro Nacional de Recursos Genéticos, Tepatitlán, Jalisco. México 2Universidad de Guadalajara, Centro de Ciencias Biológicas y Agropecuarias, Nextipac, Jalisco. México |
| Año: | 2021 |
| Volumen: | 27 |
| Número: | 3 |
| País: | México |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en español | En México se encuentran presentes 94 especies de coníferas, de las cuales el género Pinus L. destaca con 49. No obstante, los estudios de diversidad genética de poblaciones mexicanas de pinos son escasos, particularmente aquellos que incluyen marcadores moleculares, basados en secuencias simples repetidas (SSR), considerados especie -específicos, como los microsatélites. El costo inicial para su identificación es elevado cuando no se ha secuenciado el genoma de las especies, así como el diseño de cebadores que permitan la amplificación de las regiones SSR. Sin embargo, una alternativa es la evaluación de los SSRs en especies relacionadas. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la transferibilidad de marcadores SSR desarrollados para P. taeda en diferentes especies de pinos. Se extrajo ADN genómico de P. ayacahuite, P. cembroides, P. devoniana, P. hartwegii, P. lumholtzii, P. luzmariae, P. patula, P. jeffreyi y P. pseudostrobus. basado en el método de CTAB (bromuro de hexadeciltrimetilamonio) a partir de tejido liofilizado Los marcadores fueron seleccionados por grupos de ligamiento (GL), por su motivo de repetición y por su posición dentro de cada GL. Finalmente, los fragmentos amplificados por PCR fueron cuantificados. Treinta y siete marcadores (95%) amplificaron en al menos una de las nueve especies evaluadas. De ellos, 27 (69%) presentaron amplificación en más de 50% de las especies. Estos marcadores presentan cobertura en los 12 GL. Se observó amplificación de más de 75% en P. jeffreyi, P. pseudostrobus y P. devoniana. La transferibilidad de estos marcadores representa una alternativa para realizar estudios de diversidad genética en especies de pinos |
| Resumen en inglés | There are 94 species of conifers distributed in Mexico, from which Pinus L. species are the most abundant with 49 species. Nevertheless, the genetic diversity studies on Mexican populations of pines are limited, particularly those including molecular markers considered species-specific, such as microsatellites (SSR) . The initial cost for their identification is high when the species’ genome has not been sequenced, as well as the designing of primers that allow the amplification of the SSR regions. However, an alternative is the assessment of SSR in related species. The objective of this study was to evaluate the transferability of SSR markers developed for P. taeda in different pine species. Genomic DNA was isolated from P. ayacahuite, P. cembroides, P. devoniana, P. hartwegii, P. lumholtzii, P. luzmariae, P. patula, P. jeffreyi and P. pseudostrobus, based on CTAB method (ionic detergent cetyltrimethylammonium bromide) from liophylized tissue. The markers were selected based on linkage group (LG), motif and position within the LG. Finally, fragments were amplified by PCR and products were quantified. Thirty-seven markers (95%) amplified in at least one of the nine species. From those, 27 (69%) amplified in more than 50% of the species. These markers were present in the 12 LG. Amplification of more than 75% was observed for P. jeffreyi, P. pseudostrobus and P. devoniana. The transferability of these markers represents an alternative for genetic diversity studies across pine species |
| Disciplinas: | Agrociencias, Biología |
| Palabras clave: | Genética, Fitotecnia, Silvicultura, Microsatélites, Amplificación génica, Diversidad genética, Pinus, Secuencias Simples Repetidas (SSRs) |
| Keyword: | Genetics, Crop husbandry, Silviculture, Gene amplification, Genetic diversity, Pinus, Simple Sequence Repeats (SSRs) |
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