| Revista: | Ciencias marinas |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000456809 |
| ISSN: | 0185-3880 |
| Autores: | Martínez Córdova, Luis Rafael1 Martínez Porchas, Marcel2 Vargas Albores, Francisco2 Miranda Baeza, Anselmo3 Coelho Emerenciano, Mauricio4 Porchas Cornejo, Marco Antonio5 Cortes Jacinto, Edilmar6 Mazorra Manzano, Miguel Ángel2 |
| Instituciones: | 1Universidad de Sonora, Departamento de Investigaciones Científicas y Tecnológicas, Hermosillo, Sonora. México 2Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C., Departamento de Tecnología de Alimentos de Origen Animal, Hermosillo, Sonora. México 3Universidad Estatal de Sonora, Navojoa, Sonora. México 4Universidade Estadual de Santa Catarina, Centro de Educacao Superior da Regiao Sul, Laguna, Santa Catarina. Brasil 5Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste S.C., Unidad Guaymas, Guaymas, Sonora. México 6Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, Unidad La Paz, La Paz, Baja California Sur. México |
| Año: | 2018 |
| Periodo: | Dic |
| Volumen: | 44 |
| Número: | 4 |
| Paginación: | 251-266 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Aplicado, descriptivo |
| Resumen en español | Se estudió la diversidad de bacterias de biopelículas fototróficas (PAb) y heterotróficas (Hb) a través del tiempo (0, 15 y 30 días de cultivo) por medio de secuenciación masiva, considerando las regiones hipervariables V3 y V4 del gen 16S ARNr. La composición bacteriana mostró pequeños cambios durante el ensayo en términos de abundancia relativa y diversidad. Proteobacteria fue el filo más abundante en ambas biopelículas durante el experimento. Chlamidiae-Verrucomicrobia, Bacteriodetes y Planctomycetes también fueron filos abundantes en PAb, mientras que Planctomycetes, Bacteriodetes, Actinobacteria y Chlamydiae se registraron en Hb. De las lecturas asignadas a nivel de especie, un total de 27 especies autrotróficas y heterotróficas fueron detectadas en ambas biopelículas, la mayoría de ellas asociadas al metabolismo de compuestos nitrogenados y azufrados y a materia orgánica, y las restantes asociadas a las funciones estructurales en las biopelículas. Esta es la primera vez que se reporta la detección de algunas de estas especies en estas biopelículas e incluso en el ambiente marino. Los resultados sugieren la existencia de complejas redes de interacción en los conglomerados microbianos formados en las bipelículas, en las cuales las poblaciones bacterianas parecen jugar papeles metabólicos y fisiológicos importantes |
| Resumen en inglés | Bacterial diversity of phototrophic (PAb) and heterotrophic (Hb) biofilms was studied over time (0, 15 and 30 days of culture) using high throughput sequencing and considering the V3 and V4 hypervariable regions of the 16S rRNA gene. Bacterial composition in terms of relative abundance and diversity showed slight changes during the trial. Proteobacteria was the most abundant phylum in both biofilms during the experimental period. Chlamidiae-Verrucomicrobia, Bacteriodetes, and Planctomycetes were also abundant phyla in the PAb, whereas Planctomycetes, Bacteriodetes, Actinobacteria, and Chlamydiae were the abundant phyla in the Hb. Of the reads assigned up to species level, a total of 27 heterotrophic and autotrophic species were detected in both biofilms, most of them associated with the metabolism of nitrogenous and sulfurous metabolites and organic matter, and the rest with the structural functions in the biofilm. This is the first time some of these species have been reportedly detected in these biofilms or in the marine environment. Results suggest complex interaction networks in microbial conglomerates formed in biofilms, in which bacterial populations seem to play important metabolic and physiological roles |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Microbiología, Taxonomía y sistemática, Acuacultura, Calidad del agua, Análisis microbiológico, Biopelículas autotróficas, Biopelículas heterotróficas, Metagenómica, Clasificación taxonómica |
| Keyword: | Microbiology, Taxonomy and systematics, Aquaculture, Water quality, Microbiological analysis, Autotrophic biofilms, Heterotrophic biofilms, Metagenomics, Taxonomic classification |
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